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Enregistrement W4409616775 · doi:10.1016/j.exphem.2025.104791

Unbiased analysis of NUP98-KDM5A-induced murine leukemia reveals phenotypic heterogeneity recapitulating human disease subtypes

2025· article· en· W4409616775 sur OpenAlexafffund
Marilaine Fournier, Marion Dubuissez, Mathieu Neault, Jean‐Sébastien Delisle, Frédérick A. Mallette, Heather J. Melichar

Notice bibliographique

RevueExperimental Hematology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesCole FoundationFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Cancer Society
Mots-clésPhenotypeBiologyDiseaseLeukemiaCancer researchGeneticsGeneMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NUP98-KDM5A (NK5) is an oncogenic fusion protein implicated in the development of several types of acute myeloid leukemia (AML) in humans, including rare pediatric acute megakaryoblastic leukemia (AMKL). NK5 expression in murine hematopoietic progenitor cells can induce AML in mice. However, the limited number of animals and phenotypic markers used in previous studies preclude the full characterization of the AML subtypes that develop. We used NK5-transduced hematopoietic progenitor cells from murine fetal liver to generate a large cohort of mice. We then assessed the expression of a panel of myeloid markers to characterize the lineage of leukemic blasts using flow cytometry. Finally, we used bioinformatic tools to perform an unbiased analysis of mouse-to-mouse heterogeneity in leukemic cellular phenotypes. We identified phenotypically distinct subgroups among the NK5 leukemias that were predominantly segregated based on the expression of the AMKL-associated marker CD41. Our findings indicate that NK5 expression in fetal liver cells causes different types of leukemia similar in proportion to that observed in pediatric patients. The heterogeneity and mixed phenotypes observed might explain the difficulty in accurately diagnosing leukemia in some patients carrying the NK5 fusion. In addition, this approach may enable the identification of the molecular or cellular basis of the diverse NK5-driven AML types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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