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Enregistrement W4409629085 · doi:10.1158/1538-7445.am2025-6127

Abstract 6127: Genomic instability regulates STING mediated anti-tumor immunity through distinctive cytosolic DNA structures

2025· article· en· W4409629085 sur OpenAlexaff
Shayla R. Mosley, Natalie Lapa, Courtney Mowat, Kristi Baker

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStingGenome instabilityImmunityDNABiologyCancer researchCell biologyDNA damageGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background. Cancer genomes are characterized by instability, with significant levels of DNA damage and mutation due to DNA repair defects. In colorectal cancer (CRC), defects in mismatch repair define the microsatellite instable (MSI) subtype, with stronger immunogenicity and better prognosis than the more common chromosomally instable (CIN) subtype. The mechanisms behind these differences are unknown, but their understanding could identify strategies to improve CIN CRC prognosis. The STING pathway detects foreign DNA in the cytosol, leading to induction of innate and adaptive immune responses. In cancer cells, STING also recognizes self cytosolic DNA (cyDNA) in the form of micronuclei or diffuse fragments generated by endogenous or treatment induced DNA damage. Our lab previously identified this pathway as a key player in the increased cytotoxic T cell infiltration characteristic of MSI CRCs. As MSI CRCs do not contain more cyDNA than CIN, we hypothesize that specific sequence or structural patterns exist within cyDNA from different CRC subtypes that lead to differential STING activation and thereby induction of overall anti-tumor immunity. Methodology. We first aimed to examine whether cyDNA produced in MSI vs CIN CRC cells differentially induce STING and thereby anti-tumor immunity. CyDNA isolated from MC38 CRC cells with mutations in Mlh1 (modeling MSI) or Kras (CIN) were used to stimulate dendritic cells (DCs), key mediators of anti-tumor immunity. We found equal concentrations of MSI cyDNA more strongly activates STING, and thereby cytotoxic T cells, than CIN cyDNA. CyDNA from MSI CRC patient organoids showed similar results. Next, we aimed to characterize specific changes in cyDNA composition in MSI vs CIN CRC cells and examine how these alterations affect STING signalling. Sequencing identified patterns prevalent in highly stimulatory cyDNAs, including microsatellites. Stimulation with oligos and cyDNA enriched for microsatellites indicate enhanced STING and cytotoxic T cell activation through improved cGAS binding. Likewise, adoptive transfer of DCs activated by microsatellite rich DNAs induced stronger DC and T cell activation in orthotopic CIN tumors. Preliminary data suggests secondary DNA structures may influence this process. Finally, we aim to evaluate the contribution of micronuclei on STING activation in MSI vs CIN CRCs. DC stimulations with micronuclei isolated from MSI and CIN cells indicate MSI micronuclei also lead to enhanced STING activation over CIN micronuclei. We will evaluate micronuclei composition to identify underlying mechanisms. Significance. CRC is the second most deadly cancer worldwide, and immune recognition is crucial to treatment efficacy. This project will further our understanding of immune differences between MSI and CIN CRCs that may be used to develop therapeutic strategies, such as STING agonists, to improve CIN patient prognosis. Citation Format: Shayla Mosley, Natalie Lapa, Courtney Mowat, Kristi Baker. Genomic instability regulates STING mediated anti-tumor immunity through distinctive cytosolic DNA structures [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 6127.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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