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Enregistrement W4409630438 · doi:10.1158/1538-7445.am2025-5179

Abstract 5179: Investigating the tumor suppressive role of RanBP9 in mice deficient in p53

2025· article· en· W4409630438 sur OpenAlexaff
Brianna C. Gonga‐Cavé, Gabriel Onea, Xu Wang, Sean P. Cregan, Caroline Schild‐Poulter

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchMedicineChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract RAN binding protein 9 (RanBP9) is a scaffolding protein that is essential for the formation a multi-subunit E3 ubiquitin ligase termed the C-terminal to Lis-1 homology (CTLH) complex. Multiple groups have identified the CTLH complex in regulating a broad range of biological processes including cell cycle, cell proliferation, and metabolism. Various studies have demonstrated that RanBP9 functions as a tumor suppressor, but none have shown whether the loss of RanBP9 can initiate spontaneous tumor formation. Here, we investigated the tumor suppressive role of RanBP9 in C57BL/6 mice. Bulk RNA sequencing (RNA-seq) analysis of 1-month-old RanBP9-/- mice liver identified an upregulation of several oncogenic signaling genes. Although RanBP9-/- mice displayed a shortened lifespan, these mice did not develop spontaneous tumors suggesting that additional genetic perturbations are required for tumor development. Next, we conducted an observational study in mice with RanBP9+/-: Trp53+/- (R9; p53+/-) and RanBP9-/-: Trp53-/- (R9; p53-/-) genotypes. These mice were monitored over 17 months for the development of spontaneous tumors. The primary endpoint was defined as the development of a visible mass (>1.5 cm) or symptoms of cancer. R9; p53+/- mice (n=23) developed sarcomas at an earlier time compared to control p53+/- mice (n=18; p<0.05). R9; p53+/- mice displayed altered tumor spectrum with increased frequency in soft tissue sarcoma (STS) development. H&E analysis of tumor biopsies revealed increased mitotic activity of sarcomas derived from R9; p53+/- mice compared to control p53+/- mice. We observed no significant difference in tumor incidence and altered tumor spectrum in R9; p53-/- mice compared to control p53-/- mice. Analysis of TCGA sarcoma database revealed a correlation between low gene expression of CTLH complex genes and reduced survival in sarcoma patients. Our data indicates that loss of RanBP9 alone is insufficient to initiate tumor development. However, the heterozygous loss of RanBP9 and p53 promotes increased STS development. Ongoing efforts are to further characterize R9; p53+/- tumors and identify the mechanism to understand how the loss of CTLH activity contributes to sarcoma development in the absence of p53. Our findings may support the development of anti-cancer therapeutics that activates RanBP9-CTLH complex activity. Citation Format: Brianna Gonga-Cave, Gabriel Onea, Xu Wang, Sean Cregan, Patti Kaiser, Caroline Schild-Poulter. Investigating the tumor suppressive role of RanBP9 in mice deficient in p53 [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 5179.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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