Abstract 6940: Ptpn1 deficiency collaborates with a NUP98::HOXD13 fusion gene to generate B cell precursor acute lymphoblastic leukemia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Acute lymphoid leukemia is characterized by inherited or acquired mutations that effect critical differentiation and proliferation pathways. Mcm2 hypomorphic mice (Mcm2hypo)developed T cell acute lymphoblastic leukemia, due to interstitial deletions throughout the genome. When crossed with mice that expressed a NUP98::HOXD13 (NHD13) fusion gene, Mcm2hypo/NHD13 mice developed B cell precursor ALL (BCP-ALL). A majority of these BCP-ALL had acquired homozygous deletions of Ptpn1, a protein tyrosine phosphatase, leading to the hypothesis that Ptpn1 deficiency combined with NHD13 expression leads to BCP ALL. Objective: To investigate the role of Ptpn1 deletion in BCP-ALL development using mouse models. Methods: Mice expressing NHD13 fusion gene were crossed with Ptpn1-/- “knockout” mice, and then backcrossed to Ptpn1+/- mice generating 6 possible genotypes. Mice were followed for 18 months. Mice with signs of leukemia were characterized by clinical evaluation, CBC, flow cytometry, and IHC. Primary BCP-ALL and derived BCP-ALL cell lines were also evaluated with whole exome sequencing (WES), RNA-seq and molecular pathway analysis. Results: NHD13+Ptpn1-/- mice developed BCP-ALL with 65% penetrance, characterized by high WBC, anemia, thrombocytopenia, and invasion of non-hematopoietic tissues. As in human BCP-ALL, NHD13+Ptpn1-/- BCP-ALL had clonal Igh as well as clonal Tcrd gene rearrangements. Flow cytometry revealed CD19 and/or B220 expression. NHD13+Ptpn1+/- mice with BCP-ALL frequently lost the wild-type (WT) Ptpn1 allele in leukemic cells, reinforcing the hypothesis that Ptpn1 can function as a tumor suppressor gene in this context. WES revealed frequent acquired mutations in B-cell differentiation genes (Pax5 or Bcor) and activating mutations in tyrosine kinase genes (Jak1/3 and Flt3). Transcription signature analysis showed significant upregulation of mitochondrial and OXPHOS signaling genes, Hoxa/b gene clusters and RNase12. GSEA and pathway analysis indicated roles of OXPHOS signaling, Myc-E2F and Mtor signaling. Conclusion: This study demonstrates that Ptpn1 loss combined with expression of NHD13 fusion gene leads to highly penetrant BCP-ALL in mice, suggesting a role for Ptpn1 in preventing malignant transformation. These findings present a collaborative model for BCP-ALL in which the NHD13 transgene leads to increased stem cell self-renewal, somatic Bcor or Pax5 mutations block normal B cell differentiation, and somatic signaling mutations (Jak1/3, Flt3) lead to hyperproliferation, which is potentiated by Ptpn1 deficiency. Citation Format: Nupur Nigam, Toshihiro Matsukawa, Ryan Bertoli, Michel L. Tremblay, Mianmian Yin, Peter D. Aplan. Ptpn1 deficiency collaborates with a NUP98::HOXD13 fusion gene to generate B cell precursor acute lymphoblastic leukemia [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 6940.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
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Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».