Ecological traits of high-affinity hydrogen-oxidizing soil bacteria involved in the hydrogen cycle
Notice bibliographique
Résumé
Every year, soil microbial-mediated hydrogen (H 2 ) oxidation removes about 80 % of the global atmospheric H 2 , an indirect greenhouse gas. Soil-dwelling high-affinity H 2 oxidizing bacteria use this trace gas as an energy source to persist when other substrates are limited or to meet their maintenance energy requirements during dormancy. However, there is limited knowledge of the distribution, composition, diversity, and functions of this group of bacteria, particularly their ecological traits (i.e., characteristics that influence their interactions with the environment and other organisms). This is because the high-affinity H 2 -oxidizing bacteria are not phylogenetically conserved, potentially due to the horizontal transfer of their functional gene, which still needs to be demonstrated. This makes it difficult to answer ecological questions related to the distribution, functional role, and ecological contribution of H 2 -oxidizing bacteria in the soil H 2 cycle, as well as their responses to environmental factors. Such information is needed to estimate the contribution of the H 2 -oxidizing bacteria to the global H 2 cycle. Although many H 2 -oxidizing bacteria are not culturable, they may share similar ecological traits when responding to environmental changes, such as pH, moisture content, and H 2 concentrations. Therefore, a community or guild-level trait-based approach (defined as the analysis of functional traits shared by groups of bacteria (guilds) that perform similar ecological roles) could be useful to synthesize complex genomic and phylogenetic information. This review discusses the impact of soil environmental factors on soil H 2 uptake (by oxidation), and identifies ecological response traits under controlled conditions. Our approach connects the biological activity of the H 2 -oxidizing bacteria to their resident environment, for scaling up and estimating the capacity of soil microbial communities to mitigate global warming linked to increased atmospheric H 2 . • Atmospheric hydrogen cycling in soil involves hydrogen-oxidizing bacteria. • High-affinity hydrogen oxidation genes may not be conserved phylogenetically. • Method was proposed for identifying ecological traits of bacteria with hhy genes. • Ecological traits explain hydrogen-oxidizing bacteria responses to soil factors.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».