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Enregistrement W4409663953 · doi:10.1016/j.jid.2025.02.157

Cholesterol Pathway Gene Variants and Reduced Keratinocyte Cholesterol Support a Final Common Druggable Pathway in Hyperproliferative Inflammatory Skin Diseases

2025· article· en· W4409663953 sur OpenAlexaff
Melissa Riachi, Dale Bryant, James K. Ellis, Connor Hughes, Satyamaanasa Polubothu, Ignacio del Valle, Aimie Sauvadet, Nicole Knöpfel, Noreen Muwanga-Nanyonjo, Sara Barberan-Martin, Alicia L. Bruzos, Gavin Kelly, Enrica Calvani, Susana A. Palma-Duran, Mariana Silva dos Santos, Charlotte Chaloner, Youssef Khalil, Peter T. Clayton, Philippa B. Mills, Neil Bulstrode, Nick Dand, Wei-Li Di, Patricia Barral, Michael A. Simpson, James Lee, James I. MacRae, Veronica A. Kinsler

Notice bibliographique

RevueJournal of Investigative Dermatology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesGreat Ormond Street Hospital CharityUniversity College LondonUniversity of SouthamptonNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésCholesterolDruggabilityGeneBiologyKeratinocyteMedicineCancer researchPathologyGeneticsEndocrinologyCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperproliferative inflammatory skin disease (HISD) is frequently seen in rare monogenic diseases of cholesterol metabolism and responds to topical cholesterol/statin. We hypothesized that aberrant cholesterol metabolism within keratinocytes could be important in HISD more generally, driven by either immunological or lipid pathway genetic variation. Whereas other epidermal lipids have been well-characterized in HISDs, cholesterol and its metabolites have not. In this study, using comprehensive 2-dimensional gas chromatography 3-dimensional mass spectrometry, we found that primary keratinocytes from diverse monogenic HISDs (inflammatory linear verrucous epidermal nevi, n = 14; CHILD [congenital hemidysplasia with ichthyosiform erythroderma and limb defects] syndrome, n = 2) and from plaque psoriasis (n = 2) demonstrate significantly reduced mean cholesterol across all patient groups compared with those across the controls. This striking abnormality appears causally implicated because treatment in vitro with cholesterol and statin rescued the cellular hyperproliferation. Using SNPsea and burden analysis of large international psoriasis cohorts, we went on to show that GWAS hits were significantly enriched in proximity to genes encoding lipid metabolic pathways and that rare variants in lipid metabolic pathway genes were significantly enriched in patients with psoriasis. These data identify a final common pathway of aberrant keratinocyte cholesterol metabolism in HISD, which should be drugged topically to avoid first-pass metabolism. In parallel, we implicate genetic variation in lipid pathway genes in psoriasis susceptibility, potentially explaining the comorbidity of abnormal serum lipid profile and psoriasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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