Cholesterol Pathway Gene Variants and Reduced Keratinocyte Cholesterol Support a Final Common Druggable Pathway in Hyperproliferative Inflammatory Skin Diseases
Notice bibliographique
Résumé
Hyperproliferative inflammatory skin disease (HISD) is frequently seen in rare monogenic diseases of cholesterol metabolism and responds to topical cholesterol/statin. We hypothesized that aberrant cholesterol metabolism within keratinocytes could be important in HISD more generally, driven by either immunological or lipid pathway genetic variation. Whereas other epidermal lipids have been well-characterized in HISDs, cholesterol and its metabolites have not. In this study, using comprehensive 2-dimensional gas chromatography 3-dimensional mass spectrometry, we found that primary keratinocytes from diverse monogenic HISDs (inflammatory linear verrucous epidermal nevi, n = 14; CHILD [congenital hemidysplasia with ichthyosiform erythroderma and limb defects] syndrome, n = 2) and from plaque psoriasis (n = 2) demonstrate significantly reduced mean cholesterol across all patient groups compared with those across the controls. This striking abnormality appears causally implicated because treatment in vitro with cholesterol and statin rescued the cellular hyperproliferation. Using SNPsea and burden analysis of large international psoriasis cohorts, we went on to show that GWAS hits were significantly enriched in proximity to genes encoding lipid metabolic pathways and that rare variants in lipid metabolic pathway genes were significantly enriched in patients with psoriasis. These data identify a final common pathway of aberrant keratinocyte cholesterol metabolism in HISD, which should be drugged topically to avoid first-pass metabolism. In parallel, we implicate genetic variation in lipid pathway genes in psoriasis susceptibility, potentially explaining the comorbidity of abnormal serum lipid profile and psoriasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».