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Enregistrement W4409665917 · doi:10.1038/s41467-025-58996-9

Engineering coupled consortia-based biosensors for diagnostic

2025· article· en· W4409665917 sur OpenAlexafffund
Rongying Huang, Valeriia Kravchik, Rawan Zaatry, Mouna Habib, Naama Geva‐Zatorsky, Ramez Daniel

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesTechnion-Israel Institute of TechnologyEuropean CommissionCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésBiosensorComputer scienceComputational biologyNanotechnologyBiologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synthetic multicellular systems have great potential for performing complex tasks, including multi-signal detection and computation through cell-to-cell communication. However, engineering these systems is challenging, requiring precise control over the cell concentrations of distinct members and coordination of their activity. Here, we develop a bacterial consortia-based biosensor for Heme and Lactate, wherein members are coupled through a global shared quorum-sensing signal that simultaneously controls the activity of the diverse biosensing strains. The multicellular system incorporates a gene circuit that computes the minimum between each biosensor’s activity and the shared signal. We evaluate three consortia configurations: one where the shared signal is externally supplied, another directly produced via an inducible gene circuit, and a third generated through an incoherent feedforward loop (IFFL) gene circuit. Among these configurations, the IFFL system, which maintains the shared signal at low and stable levels over an extended period, demonstrates improved performance and robustness against perturbations in cell populations. Finally, we examine these coupled consortia to monitor Lactate and Heme in humanized fecal samples for diagnostics. Synthetic multicellular systems have great potential for performing complex tasks, including multi-signal detection and computation through cell-to-cell communication. Here the authors engineer microbial consortia to detect heme and lactate in fecal samples, demonstrating that coupled consortia, where members are aware of the presence of the other, exhibited enhanced diagnostic performance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,694
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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