Influenza epidemiology and co-infections within New South Wales-based multicentre health districts between 2018 and 2023
Notice bibliographique
Résumé
Influenza epidemiology spanning pre-COVID-19 pandemic to post-COVID-19 pandemic periods in Australia is insufficiently described. This study reviewed influenza epidemiology in two metropolitan New South Wales (NSW) health districts between 2018 and 2023 and investigated influenza virus (IFV) co-infections with other respiratory viruses (ORVs). A retrospective analysis of diagnostic polymerase chain reaction data from patients requiring testing for IFV and/or ORVs was conducted. Influenza detections were exceptionally low (n=57, <0.2% positivity) between April 2020 and 2021 when compared to those in 2019 (n=3,312, 14.4% positivity). Subsequent relaxation of public health measures corresponded with increased positivity rates: from 0.1% (33) in 2021 to 2.1% (4,028) in 2022 and 3.8% (4,362) in 2023. Influenza A virus (IAV) activity peaked earlier in 2022 and 2023 compared to most prepandemic years. Influenza B virus (IBV) detections were notably higher in 2019 and 2023. Co-infections were identified in 17.2% (346/2010) of IFV-positive samples, with rhinovirus being the most frequent co-infecting virus (7.4%). Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was only detected in 1.3% of IFV infections. Logistic regression revealed significantly higher odds of IFV co-infections in children aged under 5 years [odds ratio (OR) 8.18; 95% confidence interval (CI) 5.44-12.29; p<0.01] and in those aged 5-17 years (OR 2.45; 95% CI 1.59-3.77; p<0.01). A significant increase in the likelihood of IFV co-infection was also observed in 2022 (OR 2.42; 95% CI 1.23-4.75; p<0.05). This study described influenza epidemiology across pre-COVID-19 pandemic, during-COVID-19 pandemic, and post-COVID-19 pandemic periods in NSW. Key findings include the earlier IAV peak activity in 2022-2023 and a rapid increase in IBV detection rate from 2022 to 2023, underscoring the need for sustained influenza surveillance to monitor the persistence of these trends. The surge in influenza detections in 2022-2023, accompanied with increased testing volumes, suggests that future surveillance efforts should account for changes in rates of testing when assessing severity of influenza seasons. The higher IFV co-infection frequency was observed in children and adolescents. 'Flurona' cases remain infrequent and exclusively associated with IAVs. These insights also inform the future application of multiplex diagnostic methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».