Structural and functional insights into extreme thermal stability and activity of two <scp>GH</scp> 12 domains of a multidomain glycosidase from a hyperthermophilic euryarchaeon
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria and fungi are well known for efficient degradation of plant polysaccharides thanks to various enzymes involved in plant cell wall decomposition. However, little is known about the role of archaea in this process or the repertoire and features of their polysaccharide‐degrading enzymes. In our previous work, we discovered an archaeal multidomain glycosidase (MDG) composed of three catalytic domains (GH5 and two GH12) and two cellulose‐binding modules (CBM2). The recombinant MDG and individual GH5 catalytic domain were active against cellulose and a number of other polysaccharides at a wide range of temperatures, with optimum temperatures ( T opt ) of 60 °C and 80 °C, respectively. The present study was focused on the characterization of two GH12 domains of the MDG. Purified recombinant TMDG_GH12‐1 and TMDG_GH12‐2 proteins were active as individual enzymes but exhibited distinct catalytic properties. Both enzymes were thermostable and active at extremely high temperatures: TMDG_GH12‐1 was active at 40–130 °C ( T opt 100 °C), and its half‐life ( t ½ ) at 100 °C was 42 h, which makes it one of the most thermostable glycosidases known so far, whereas TMDG_GH12‐2 was active at 50–100 °C ( T opt 90 °C) with t ½ at 100 °C being 30 min. Phylogenetic and structural analysis of both TMDG_GH12 proteins together with molecular docking and site‐directed mutagenesis suggested that the presence of two disulfide bridges and the W → Q mutation in the active site contribute to the exceptional thermostability of TMDG_GH12‐1. Further structural and mutational studies of the TMDG_GH12‐1 domain will help to gain a better understanding of the molecular mechanisms of its extraordinary thermostability and substrate specificity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».