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Enregistrement W4409726982 · doi:10.1101/2025.04.21.649884

Conjugative transfer inhibition of IncA and IncC plasmids by pervasive SGI1-like elements via relaxosome assembly interference

2025· preprint· en· W4409726982 sur OpenAlexaff
Florence Deschênes, Romain Durand, Kévin Huguet, Nicolas Rivard, Chloé Chagnon, Doriane Planez, Vincent Burrus

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueGraphene and Nanomaterials Applications
Établissements canadiensUniversité LavalUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterference (communication)PlasmidTransfer (computing)Computer scienceBiologyGeneticsComputer networkGeneOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Broad-host-range IncA and IncC (A/C) conjugative plasmids propagate multidrug resistance in bacteria and mobilize chromosomal resistance islands, including Salmonella Genomic Island 1 (SGI1) across genera. A/C plasmids usually mobilize SGI1 at very high frequencies while being inhibited by SGI1. Here, we identified a broadly conserved fertility inhibitor, which we named CtiC (for 'Conjugative Transfer Inhibition of IncC'), encoded by SGI1 and kin, that hampers A/C plasmid transfer. ctiC expression is both constitutive and activated during conjugative transfer of A/C plasmids. Our results indicate that the suppression of ctiC significantly enhances plasmid transfer, suggesting it counters a general improvement in conjugation mediated by the two genes traHG, located upstream of ctiC in SGI1. CtiC specifically prevents the cotransfer of the helper plasmid, which destabilizes SGI1 in transconjugants. Structural predictions revealed that CtiC resembles the C-terminus of the MOBH12-family relaxase TraI of A/C plasmids. Bacterial two-hybrid assays and relaxase domain substitutions show that CtiC interferes with relaxosome assembly by binding to the plasmid-encoded mobilization factor MobI, which recognizes the origin of transfer, thus preventing its interaction with TraI. Our work reveals a fertility inhibition mechanism that prevents relaxosome assembly and uncovers a functional domain in MOBH12 relaxases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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