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Enregistrement W4409727573 · doi:10.1016/j.gimo.2025.103431

Estimation of PEX1-mediated Zellweger spectrum disorder births and population prevalence by population genetics modeling

2025· article· en· W4409727573 sur OpenAlex
Karen E. Malone, Catherine Argyriou, Evelyn M. Zavacky, Nancy Braverman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesFoundation Fighting Blindness
Mots-clésPopulationGeneticsZellweger syndromeBiologyPopulation geneticsMedicineEnvironmental healthPeroxisomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Zellweger Spectrum Disorder (ZSD) is a rare syndromic disorder characterized by impaired peroxisome assembly and function. Many cases are due to pathogenic variants in the PEX1 gene and are inherited in an autosomal recessive manner. As with many rare diseases, understanding the disease burden and scale of unmet need is challenging but required to support diagnosis, disease management, and development of therapies. We present a population-genetics-based model to estimate births and overall disease prevalence for patients in the United States, European countries, and Japan. Methods We utilized large-scale genetic diversity data sets to estimate the mutational burden per region and integrated genotype-phenotype relationships with real-world survival data to provide patient number estimates for severe, intermediate, and mild segments per age and country. Results We observed regional differences in the variant landscapes expected to contribute to PEX1 -mediated ZSD ( PEX1 -ZSD). Conservative prevalence estimates for the United States, United Kingdom, Germany, France, Italy, Spain, and Japan based solely on known pathogenic variants indicates nearly 500 patients in total. Incorporating predicted pathogenic variants into our model suggests an additional 260 patients with intermediate phenotype and 930 patients with mild phenotype, under the age of 30, across these countries. Conclusion Notably, our model indicates that a significant proportion of patients with intermediate/mild phenotype may go unrecognized by current diagnostic practices. This diagnosis independent model of patient number estimates provides additional insights into the broad spectrum of PEX1 -ZSD on a more global scale and can be used to inform health care strategies for these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,663
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle