Defects in B Cell Differentiation and Antibody Production due to Biallelic TANK Mutation
Notice bibliographique
Résumé
Exposure to bacterial respiratory pathogens is commonplace, but severe recurrent disease requiring hospitalization may suggest an underlying IEI. We studied a pair of siblings with decade-long histories of severe recurrent lower respiratory tract infections and positive cultures for Streptococcus pnuemoniae. These patients had normal total B cell counts but reduced generation of B cell memory and low antibody levels. CyTOF analysis showed all other immune cell subsets were present at normal frequencies. No mutations in known IEI-causal genes explained these patients’ phenotypes. By whole-exome sequencing, we identified a novel mutation in TANK, which segregated in an autosomal recessive manner. This mutation caused a frameshift and early truncation of the TANK protein, and complete TANK deficiency in the patients’ cells. TANK is an adaptor protein with poorly characterized roles in both canonical and noncanonical NF-kB signaling. Using an in vitro B cell differentiation assay, we know that TANK-deficient patients’ B cells seem “blocked” at the IgD-CD27- double-negative stage and proliferate poorly. Using scRNA-seq of patient and healthy control samples, we show an accumulation of intermediate B cells with a unique gene, including high SOX5 expression. Mechanistically, TANK suppresses the canonical NF-kB pathway and serves as a critical determinant of B cell proliferation and differentiation, antibody secretion, and protection from respiratory pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».