Genotype–Phenotype Relations for the Dystonia-Parkinsonism Genes GLB1, SLC6A3, SLC30A10, SLC39A14, and PLA2G6: MDSGene Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
The Movement Disorders Society recommends the DYT/PARK prefix for genes where dystonia and parkinsonism are prominent in approximately half or more of patients. This systematic review explores the genotype–phenotype correlations of GLB1, SLC6A3, SLC30A10, PLA2G6, and SLC39A14—recently classified as DYT SLC39A14 and historically linked to dystonia-parkinsonism. We searched PubMed and the Human Gene Mutation Database using standardized terms, including English-language, peer-reviewed publications up to February 2024. Following the MDSGene protocol, we extracted individual-level data on patients with biallelic pathogenic variants and at least one movement disorder. Features were marked “missing” if not explicitly reported. Of 1828 articles, 128 were eligible. We identified 386 patients and 262 variants. The median age at onset was 3 years for GLB1, 3 months for SLC6A3, 2.5 years for SLC30A10, 1.5 years for SLC39A14, and 16 years for PLA2G6. Missing data may reflect underreporting of negative findings. Case reports/serie, may bias toward atypical presentations. Our analysis showed dystonia-parkinsonism predominates in SLC6A3 and PLA2G6, while GLB1, SLC30A10, and SLC39A1 show predominantly dystonic phenotypes with a low frequency of parkinsonism. Ataxia was common in GLB1 and PLA2G6. Awareness of these phenotypes is essential for early diagnosis and intervention, particularly in treatable conditions like SLC30A10 or SLC39A14. The predominantly dystonic phenotype in GLB1, SLC30A10, and SLC39A14 suggest that the DYT prefix may be more appropriate, highlighting the need to reconsider their nomenclature, and the importance of systematic reviews.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,023 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,010 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».