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Enregistrement W4409864352 · doi:10.1038/s41598-025-99226-y

Elevated Fab glycosylation of autoantibodies maintained during B cell depletion therapy

2025· article· en· W4409864352 sur OpenAlexaff
Anika M. Valk, Jana Koers, Ninotska I. L. Derksen, Laura Hogenboom, Zoé van Kempen, Joep Killestein, Abraham Rutgers, Peter Heeringa, Barbara Horváth, Taco W. Kuijpers, S. Marieke van Ham, Anja ten Brinke, Diane van der Woude, René E. M. Toes, Nicolaas A. Bos, Theo Rispens

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesUniversiteit van AmsterdamLandsteiner Foundation for Blood Transfusion ResearchVasculitis Foundation
Mots-clésGlycosylationAutoantibodyImmunologyN-linked glycosylationMedicineAntibodyChemistryGlycanComputational biologyBiologyBiochemistryGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several chronic autoimmune diseases are characterized by elevated autoantibody Fab glycosylation. Whether Fab glycans link to disease state or development remains unclear, yet may serve as a marker thereof. Many autoimmune diseases are treated with B cell depletion therapies that particularly result in a decline of autoantibodies. The question arises whether B cell depletion therapy may have an impact on Fab glycosylation. Here, we investigated the longitudinal effects of B cell depletion therapy on Fab glycosylation of total IgG and IgG autoantibodies in rheumatoid arthritis (RA), pemphigus vulgaris (PV), ANCA-associated vasculitis (AAV), and multiple sclerosis (MS). Baseline Fab glycosylation was compared to 6-12 months into therapy by lectin affinity chromatography, determining Fab sialylation as an estimate of Fab glycosylation. We observed a modest decrease in Fab glycosylation of total IgG for RA (median 13.8%[IQR 11.7-16.3] - 9.1%[IQR8-11]) and PV (16.4%[IQR14.9-17.5] - 13.01%[IQR10.8-15.5]) after 6 months, whereas for AAV Fab glycosylation slightly increased (11.6%[IQR7.4-15] - 14.9%[IQR11.4-19.3]), and no changes were found for MS. Autoantibody titers (anti-CCP, anti-PR3, anti-Dsg3) had declined following B cell depletion therapy, yet their elevated Fab glycosylation levels were maintained. Taken together, Fab glycosylation levels of autoantibodies do not decrease upon B cell depletion therapy, thereby retaining their predictive potential as biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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