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Enregistrement W4409889201 · doi:10.3389/fmicb.2024.1384204

Comparative analysis of the soil microbiome and carbohydrate content of Anthoxanthum nitens (Sweetgrass) and other Poaceae grass tissues and associated soils

2025· article· en· W4409889201 sur OpenAlexaff
Marissa L. King, Barinder Bajwa, N. Hanna, Xiaohui Xing, Kristin E. Low, Patrick Neuberger, Erin L. Hall, Brett Weighill, Leeann Klassen, Noreen Plain Eagle, William B. Bull, Laura S. Lynes, Tony Montina, Philippe J. Thomas, Monika A. Gorzelak, D. Wade Abbott

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaCanmore Museum and Geoscience CentreUniversity of LethbridgeAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPoaceaeSoil waterBotanyMicrobiomeAgronomyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sweetgrass (Anthoxanthum nitens) is a culturally and environmentally significant perennial grass to many Indigenous Peoples; however, little is known about the potential of Sweetgrass as a contributor to soil health, biodiversity, and climate adaptation. Here, a team of transdisciplinary experts from academia, a non-governmental organization, and a First Nation community collaborated to investigate the structural composition of the rhizomes, stems, and leaves of greenhouse-grown Sweetgrass in comparison to other Poaceae grass members found in a nearby field. The data shows that the monosaccharide composition of A. nitens was evenly distributed throughout the three tissues, and that cellulose was the predominant polysaccharide followed by glucuronoararbinoxylans. There were lesser amounts of xyloglucans, mixed-linkage glucans, homogalacturonans, and rhamnogalacturonans as the hemicellulosic and pectic polysaccharides, respectively. The carbohydrate composition seen in A. nitens was consistent with the other Poaceae grasses evaluated in this study, with the exception of Setaria chondrachne, which contained elevated pectin levels in its stems and leaves. Additionally, the analysis of the carbohydrate content within the soil samples revealed a higher abundance of carbohydrates within greenhouse soil when compared to field soil samples, with significantly more mannose, galactose, and galacturonic acid. Further, there were structural differences in the microbial communities across sampling sites, including a significant increase in the abundance of Bacillus spp. in the greenhouse soil. Overall, this study provides the glycome and associated soil microbial community baseline for greenhouse-grown Sweetgrass.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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