Prevalence of enteric pathogens in diarrhoeic and nondiarrhoeic foals
Notice bibliographique
Résumé
Background : Diarrhoea is a significant cause of morbidity and mortality in foals. However, further research is needed to understand the occurrence of pathogens in both single and coinfections among extensively raised foals, with and without diarrhoea. Hypothesis/Objectives : Our hypothesis is that foals with diarrhoea have a greater prevalence of organisms detected in coinfections. Therefore, this study investigated the major microorganisms associated with diarrhoea in foals with and without diarrhoea. Study design : A total of 200 foals (100 diarrhoeic and 100 nondiarrhoeic), up to 1 year of age, were included in this study. Methods : Faecal samples were analysed for the detection of Clostridioides difficile (bacterial culture and toxin A/B detection), Clostridium perfringens (bacterial culture and genotyping) and Salmonella spp., Rhodococcus equi , Lawsonia intracellularis , Neorickettsia risticii , Enterococcus durans , Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp. , rotavirus A and coronavirus (real-time PCR). Results : At least one enteric agent was detected in 85% and 70% of diarrhoeic and nondiarrhoeic foals, respectively. Codetection was significantly more frequent in the diarrhoeic group (27 singly detected organisms vs. 58 codetected organisms) than in the nondiarrhoeic group (37 singly detected organisms vs. 33 codetected organisms) (P = 0.0079). Salmonella spp., C. difficile (and A/B toxin gene detection) and Cryptosporidium spp. were significantly associated with foal diarrhoea. Conclusions and clinical relevance : The detection of multiple agents in foals with diarrhoea highlights the complexity of diagnosis and the potential interaction between agents in the multifactorial aetiology of this condition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».