MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4409907075 · doi:10.1016/j.yrtph.2025.105835

HESI GTTC ring trial: Concordance between Ames and rodent carcinogenicity outcomes for N-nitrosamines (NAs) with rat and hamster metabolic conditions

2025· article· en· W4409907075 sur OpenAlexaff
Joel P. Bercu, Alejandra Trejo‐Martin, Connie L. Chen, Maik Schuler, Jennifer Cheung, Tetyana Cheairs, Anthony M. Lynch, D. Thomas, Andreas Czich, Aisar Atrakchi, Timothy J. McGovern, Robert H. Heflich, Alisa Vespa, Roland Froetschl, Yi Yan Yang, Raj D. Gandhi, Joanne Elloway, Verena Ziegler, Michelle Schaefer, Rachael E. Tennant, Walter M.A. Westerink, Robert A. Jolly, Jessica Noteboom, Pavan Gollapudi, Zhanna Sobol, Katerine K McGettigan, Joel S Christensen, Stéphanie Simon, J Dieckhoff, Andreas Zeller, C Marchand, Kerstin Waese, Michelle E. Bishop, Penny Leavitt, Victoria V. Hargreaves, Connor Glick, Yang Liao, Rosalie K. Elespuru, Raechel Puglisi

Notice bibliographique

RevueRegulatory Toxicology and Pharmacology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth and Environmental Sciences InstituteU.S. Food and Drug AdministrationGilead SciencesU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésConcordanceCarcinogenHamsterRodentToxicologyRing (chemistry)BiologyPharmacologyChemistryMedicineGeneticsInternal medicineOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A multi-sector study (i.e., Ring Trial) was designed to improve the in vitro detection of N -nitrosamine (NA)-associated mutagenicity by optimizing the bacterial reverse mutation (i.e., Ames) assay protocol and testing various conditions on the sensitivity and specificity for the prediction of rodent carcinogenicity. A total of 29 NAs and 3 N -nitroso drug-like compounds from different structural classes and carcinogenicity outcomes were tested (two independent laboratories per compound) across 5 bacterial strains using a 30-min pre-incubation protocol. To evaluate the impact of different metabolic activating systems (MASs), testing conditions included the use of 10 or 30 % liver S9 fractions prepared from rats or hamsters pretreated with inducers of enzymatic activity. Results indicate that E. coli and Salmonella typhimurium strains detecting single base pair mutations, coupled with MASs containing 30 % hamster S9s were the most sensitive (90 %) for identifying NAs that are rodent carcinogens. Regarding MAS combinations, the highest sensitivity was 30 % rat and 30 % hamster (93 %), but has low specificity (45 %), with good laboratory agreement for the Ames calls (91 %). DMSO and water were considered suitable solvents, except for small-molecular weight alkyl NAs. These results will support harmonized Ames testing of NAs, giving high confidence for a negative result. • 30 % hamster S9 had the highest sensitivity of all individual MASs. • 30 % S9 (rat or hamster) had a higher sensitivity than 10 % S9 (rat or hamster). • -S9 and 30 % rat and hamster S9 had high sensitivity (93 %) but low specificity (45 %). • Specificity was similar amongst S9 species or concentration. • DMSO and water were suitable solvents for NA Ames testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil0,815

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueRegulatory Toxicology and PharmacologyMême sujetGlutathione Transferases and PolymorphismsTravaux en français237 207