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Enregistrement W4409920109 · doi:10.1016/j.tice.2025.102933

Enhancing TB diagnosis: Improving specificity with scFv antibodies targeting the PPE17 epitope

2025· article· en· W4409920109 sur OpenAlexaff
Kamran Heidarnejad, Mehrzad Bahtouee, Seyed Nooreddin Faraji, Setareh Moazen, Farhad Abbasi, Amirhossein Sahebkar, Foroogh Nejatollahi

Notice bibliographique

RevueTissue and Cell · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesShiraz University of Medical Sciences
Mots-clésEpitopeAntibodyVirologyComputational biologyLinear epitopeMedicineImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Serological assays have demonstrated enhanced simplicity, accuracy, and effectiveness in detecting Mycobacterium Tuberculosis (Mtb) antigens. The proline-proline-glutamic acid 17 (PPE17) antigen, specifically localized on the surface of Mtb, has been identified as unique to the Mtb species. The unique properties of single-chain antibodies make them well-suited for accurate diagnostic applications. In this study, specialized single-chain antibodies (scFvs) targeting PPE17 were employed to create a precise indirect immunofluorescent assay for diagnosing pulmonary tuberculosis (TB). METHODS: To select an immunodominant epitope of PPE17 in silico analysis was applied. The sequence was evaluated using the BLAST algorithm. A phage antibody display library of scFv was applied and two scFvs were isolated against the epitope by panning process. Specific clones were distinguished through PCR and DNA fingerprinting techniques. The reactivity of the chosen scFvs towards the selected epitope was assessed by ELISA. An Indirect Immunofluorescence Assay (IFA) was performed on 50 positive and 50 negative TB sputum smears, which were confirmed through both culture and genotype methods, to evaluate the performance of anti-PPE17 scFvs in accurately and rapidly detecting TB-positive smears, and TB-negative and Nocardia smears serving as negative controls for comparison. RESULTS: An immunodominant epitope of the PPE17 antigen consisting of amino acids 27-39, was identified. Two specific anti-PPE17-scFvs with frequencies of 25 % and 20 % were selected. ELISA results confirmed the reactivity of the scFvs against the epitope. Immunofluorescence assays demonstrated positive results for both antibodies when tested against positive TB sputum smears, whereas no positive results were obtained in tests against TB-negative and Nocardia smears. CONCLUSION: A fast and accurate indirect immunofluorescence assay was developed to identify Mtb bacteria in TB sputum smears using specific anti-PPE17 scFvs. The results illustrated the capability of both scFvs in detecting Mtb in TB samples and differentiating Mtb from Nocardia smears. This suggests the potential for a novel diagnostic test that ensures precise TB detection in sputum samples, thereby preventing any potential misdiagnosis of tuberculosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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