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Enregistrement W4409959281 · doi:10.1101/2025.04.25.650559

Molecular Basis of Ionic Suppression of ZAP-70 Dependent T Cell Receptor Activation

2025· preprint· en· W4409959281 sur OpenAlexfundno aff
Swarnendu Roy, Soumee SenGupta, Kaustav Gangopadhyay, Jibitesh Das, Prosad Kumar Das, Manas Pratim Chakraborty, Samiran Mondal, Bidisha Sinha, Amirul Islam Mallick, Rahul Das

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacological Effects of Natural Compounds
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesIndian Institute of Science Education and Research KolkataIndian Institute of Science Education and Research MohaliDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaMcMaster University
Mots-clésReceptorBiophysicsChemistryCell biologyBasis (linear algebra)Ionic bondingBiologyBiochemistryMathematicsIon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ionic imbalance in the tumor microenvironment alters the tumor-infiltrating T lymphocyte function. High extracellular K + suppresses T cell function by negatively regulating T cell receptor (TCR) signaling. In contrast, elevated extracellular Na + enhances T cell effector function by boosting the phosphorylation of TCR signaling modules. Here, we presented a mechanism explaining how the two monovalent cations differently regulate TCR function. At rest, high intracellular K + uncouples allosteric recruitment of ZAP-70, a key signaling module, to the TCR complex. The formation of antigen TCR complex induces K + efflux, causing spontaneous recruitment of ZAP-70 to the TCR. Increasing extracellular K + perturbs K + efflux and slows ZAP-70 recruitment to the TCR complex, even upon antigen binding. This leads to defects in T cell development and arthritis-like symptoms in juvenile mice. We conclude that K + dynamics is integral to T cell ligand discrimination and fundamental to turning off the signaling during T cell quiescence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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