Resistance development and transcriptional responses of Salmonella enterica strains to bacteriophage SF1 treatment on Arabidopsis thaliana
Notice bibliographique
Résumé
This study explores the prevalence and mechanisms of in vitro and in planta phage resistance in Salmonella enterica, a critical concern for food safety. We examined three Salmonella Typhimurium strains, ST001, ST536, and ST580, that developed phage resistance on Arabidopsis plants. Strains ST001 and ST536 exhibited strong phage resistance and cross-resistance to heat, while ST580 was more susceptible, showing greater population declines and requiring a longer adaptation period. Interestingly, despite gaining phage resistance, all three strains became more sensitive to oxidative and acidic stressors, suggesting potential applications for food industry controls. RNA-seq analysis indicated diverse transcriptional responses to phage exposure: ST580 displayed significant gene expression changes, while ST001 and ST536 increased resistance through enhanced membrane protein synthesis and upregulated ribosome and membrane protein localization genes. ST001 also reduced O-antigen synthesis, blocking the SF1 phage receptor. These transcriptional trends were corroborated by phage attachment assays and membrane protein measurements, highlighting distinct adaptive mechanisms. Unlike ST001 and ST536, ST580's resistance was inadequate to prevent phage adsorption, leading to more reactive transcriptional responses. This research underscores the complexity of phage-host interactions and reveals potential trade-offs, such as increased sensitivity to oxidative and acidic stresses. It offers insights into the dynamics of phage resistance, which could improve phage applications against foodborne pathogens, enhancing the efficacy and sustainability of phage-based safety interventions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».