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Enregistrement W4410039083 · doi:10.3390/insects16050486

Unusual Genetic Diversity Within Thereuopoda clunifera (Wood, 1862) (Chilopoda: Scutigeromorpha) Revealed by Phylogeny and Divergence Times Using Mitochondrial Genomes

2025· article· en· W4410039083 sur OpenAlexaff
Jie-Hong Ji, Hui-Yuan Wu, Chen-Yang Shen, Kenneth B. Storey, Dan‐Na Yu, Jia‐Yong Zhang

Notice bibliographique

RevueInsects · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyPhylogeneticsMyriapodaCladeDivergence (linguistics)Phylogenetic treeGenetic divergenceZoologyCoevolutionMolecular clockGenetic diversityEcologyTaxonomy (biology)GeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As one of the four primary evolutionary groups within myriapods, centipedes (Chilopoda) comprise approximately 3150 valid species. Recent molecular studies have begun to elucidate the phylogeny and time to divergence in Chilopoda; yet, identifying scutigeromorphs at the species level remains a notoriously challenging task. In this study, we obtained seven new complete mitogenomes of Thereuopoda clunifera (Wood, 1862) to investigate the phylogeny and divergence times of Chilopoda. Both maximum likelihood (ML) and Bayesian inference (BI) analyses recovered the relationship of (Scutigeromorpha + (Scolopendromorpha + (Lithobiomorpha + Geophilomorpha))). For Scutigeromorpha, seven newly sequenced mitogenomes of T. clunifera were divided into four distinct clades. Divergence time estimates suggest that the basal split of Chilopoda occurred during the Middle Ordovician period, with the origins of Scolopendromorpha, Lithobiomorpha, and Geophilomorpha dating to the Devonian period. Factors such as warm climates, coevolution between predator and prey, and the rifting of the Hainan Island may have driven the diversification of Scutigeromorpha. Based on genetic distance, the delimitation of molecular species, phylogenetic relationships, and divergence time analyses, we identified three cryptic species that existed within T. clunifera. This exceptionally high degree of hidden diversity can be ascribed to the morphological stasis that has occurred since the Paleozoic era and taxonomic impediment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,441
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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