Unusual Genetic Diversity Within Thereuopoda clunifera (Wood, 1862) (Chilopoda: Scutigeromorpha) Revealed by Phylogeny and Divergence Times Using Mitochondrial Genomes
Notice bibliographique
Résumé
As one of the four primary evolutionary groups within myriapods, centipedes (Chilopoda) comprise approximately 3150 valid species. Recent molecular studies have begun to elucidate the phylogeny and time to divergence in Chilopoda; yet, identifying scutigeromorphs at the species level remains a notoriously challenging task. In this study, we obtained seven new complete mitogenomes of Thereuopoda clunifera (Wood, 1862) to investigate the phylogeny and divergence times of Chilopoda. Both maximum likelihood (ML) and Bayesian inference (BI) analyses recovered the relationship of (Scutigeromorpha + (Scolopendromorpha + (Lithobiomorpha + Geophilomorpha))). For Scutigeromorpha, seven newly sequenced mitogenomes of T. clunifera were divided into four distinct clades. Divergence time estimates suggest that the basal split of Chilopoda occurred during the Middle Ordovician period, with the origins of Scolopendromorpha, Lithobiomorpha, and Geophilomorpha dating to the Devonian period. Factors such as warm climates, coevolution between predator and prey, and the rifting of the Hainan Island may have driven the diversification of Scutigeromorpha. Based on genetic distance, the delimitation of molecular species, phylogenetic relationships, and divergence time analyses, we identified three cryptic species that existed within T. clunifera. This exceptionally high degree of hidden diversity can be ascribed to the morphological stasis that has occurred since the Paleozoic era and taxonomic impediment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».