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Enregistrement W4410087515 · doi:10.1109/wi-iat62293.2024.00126

Protein Sequence Prediction Based on Feature Combination and Attention Mechanism

2024· article· en· W4410087515 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceMechanism (biology)Sequence (biology)Feature (linguistics)Artificial intelligenceProtein sequencingComputational biologyPattern recognition (psychology)Peptide sequenceChemistryBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identifying protein functions is crucial for understanding biological mechanisms and advancing life sciences. However, current protein prediction methods fail to fully exploit sequence information, resulting in limitations in prediction accuracy. To address this issue, we propose a protein sequence prediction network (ECPN-HFGF-ATT) that incorporates feature combination and an attention mechanism. The proposed method initially employs a residual network to extract shared features from protein sequences, followed by hierarchical and global feature extraction modules to capture more detailed hierarchical and global sequence characteristics. Next, the prediction results from both feature types are integrated, and the attention mechanism is applied to enhance prediction accuracy. Experimental results demonstrate that the ECPN-HFGF-ATT method achieves superior performance in protein sequence prediction, with macro and micro F1 scores of 95.5% and 99.0%, respectively. The ECPN-HFGF-ATT method effectively integrates hierarchical and global features, enabling rapid and accurate identification of protein sequences. Compared to commonly used methods, this approach significantly enhances prediction accuracy, offering a powerful tool for advancing protein sequence research and applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,815
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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