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Enregistrement W4410121469 · doi:10.1101/2025.05.02.651944

Chinmo is a novel regulator of differential Hippo signaling response within a single developing organ

2025· preprint· en· W4410121469 sur OpenAlexaff
Shreeharsha Tarikere, Tarun Kumar, Guillem Ylla, Cassandra G. Extavour

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesFaculty of Arts and SciencesNational Institutes of HealthHarvard UniversityHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologySomatic cellHippo signaling pathwayCell biologyRegulatorGerm cellGermlineTranscription factorDrosophila melanogasterSignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Orchestrated control of proliferation of multiple cell types is essential for building a healthy organ. Here we use larval ovary development in Drosophila melanogaster as a model to understand the homeostasis of somatic and germ line cells in the formation of the female adult reproductive organ. We previously showed that the highly conserved Hippo signaling pathway regulates proliferation of both germ line and somatic cells in the D. melanogaster larval ovary. Response to Hippo signaling appeared to be mediated by different genetic mechanisms in germ line and soma, but the mechanism allowing distinct responses to the same signaling pathway remained unknown. Here we perform cell type-specific RNA-Seq of isolated germ line and somatic cells from the developing ovary at multiple time points spanning the formation of germ line stem cell niches, in either a Hippo signaling loss- or gain-of-function genetic background. Applying network analysis to these data revealed a novel regulator of ovarian development, the transcription factor chinmo . Subsequent experimental validation showed that chinmo acts as a key germ cell-specific translator of Hippo signaling in the developing ovary, allowing the Hippo signal to be transduced in cell type-specific ways in germ line and somatic cells within the same organ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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