MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410131622 · doi:10.1038/s41598-025-00549-7

Genomic and transcriptomic landscapes of metastatic neuroendocrine neoplasms from distinct primary sites and their clinical implications

2025· article· en· W4410131622 sur OpenAlexafffund
Kathleen Wee, Kevin Yang, David F. Schaeffer, Chen Zhou, Emily Leung, Xiaolan Feng, Janessa Laskin, Marco A. Marra, Jonathan M. Loree, Sharon M. Gorski

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Cancer AgencyUniversity of British ColumbiaIsland HealthSpinal Cord Injury BCPancreas Centre (Canada)Vancouver General HospitalCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteBC Cancer FoundationNational Human Genome Research InstituteMichael Smith Health Research BCCanadian Cancer SocietyGenome British ColumbiaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreNeuroendocrine Tumor Research Foundation
Mots-clésTranscriptomeComputational biologyBiologyGenomeGene expression profilingBioinformaticsGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuroendocrine neoplasms (NENs) encompass a highly heterogeneous group of neoplasms with varying prognoses and molecular alterations. Molecular profiling studies have furthered our understanding of NENs, but the majority of previous studies have focused on primary tumors and on mutational landscapes using DNA sequencing data. Here, we describe the genomic and transcriptomic landscapes of 28 metastatic NENs across different primary anatomical sites (PASs) and their potential clinical implications. Although our cohort is small, our analyses provide further insights on the molecular commonalities and distinctions between metastatic NENs of different PASs. Comparison to several reference transcriptome data sets revealed that despite considerable whole genome and transcriptome variability in NENs, the metastatic NENs are still more like each other than other cancer types. Our study also highlights the potential utility of NEN transcriptome data for molecular classification and clinical decision making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetNeuroendocrine Tumor Research AdvancesTravaux en français237 207