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Enregistrement W4410153274 · doi:10.1038/s41397-025-00370-5

The interplay between SLC6A4 and HTR1A genetic variants that may lead to antidepressant failure

2025· article· en· W4410153274 sur OpenAlexaff
Salma Toma Hanna, Mark Faiz, Sanjida Ahmed, Sara Temkit, Cristina Núñez, Feng C. Zhou

Notice bibliographique

RevueThe Pharmacogenomics Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensYork Central Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntidepressantLead (geology)GeneticsPsychologyNeuroscienceBiologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The serotonin transporter (SLC6A4) and the serotonin autoreceptor (HTR1A) are two of the most extensively studied genes in the field of psychiatry, and their variants have been implicated in antidepressant response, specifically with selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs) which are widely regarded as the first-line medications for depression and anxiety. Variants of SLC6A4 and HTR1A have also been studied as risk factors for depression. In this retrospective study, we aim to investigate the relationship between all possible serotonin transporter (SLC6A4) and autoreceptor (HTR1A) variant expression combinations that may have contributed to the therapeutic failure of an SSRI and subsequent disability. In this study, we utilize data from a cohort of 302 European patients diagnosed with depression and/or anxiety who were referred to Personalized Prescribing Inc. (PPI) in 2022 as result of a mental health disability claim to determine whether statistical differences are present in this cohort as compared to general European population allele frequencies. Our data reveals the presence and relevance of significant differences in the presentation of SLC6A4 and HTR1A, specifically in a disability cohort, relative to the average European population. The SLC6A4 gene codes for the serotonin transporter; the SSRI drug target that aims to be blocked to prevent the recycling of serotonin, whereas the HTR1A plays an indirect role as an autoreceptor allowing serotonin levels to be maintained by the SSRI, as well as a direct role in modulating mood through post-synaptic serotonin interaction. This study has revealed statistically significant differences in the expression of these two genes together in increasing the likelihood of drug failure, specifically the presence of one or more G alleles at HTR1A rs6295 in combination with the SLC6A4 SS variant. The most significantly overrepresented combination in this cohort of patients suffering from depression and anxiety that have failed to achieve adequate symptom remission on previous SSRI trials is HTR1A rs6295 GG-SLC6A4 SS which is overrepresented in this study by over 74% at a p-value well below 0.01. Genotyping anti-depressant drug targets may play an important role in optimizing anti-depressant drug response and research developments for future therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,330
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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