Endangered Deep‐Snow Mountain Caribou Have a Distinct Winter Diet and Gut Microbiome That May Be Altered by Maternal Penning
Notice bibliographique
Résumé
Understanding species- or population-specific dietary specialisation is key to informing habitat conservation needs and successful ex situ recovery programs for many endangered species. One of the most endangered populations in Canada, the behaviourally distinct deep-snow ecotype of the Southern Mountain caribou, is characterised by a winter diet of arboreal rather than terrestrial lichens. We hypothesised that this dietary variation would produce a distinct gut microbiome in deep-snow mountain caribou relative to their shallow-snow counterparts. We additionally hypothesised that the temporary alteration of natural diets for ex situ conservation programs, including the provision of commercial pelleted feed and volunteer-collected lichens during maternity penning of pregnant cows, may alter this specialised microbiome. Here, we use faecal DNA metabarcoding to compare diet and gut microbiome composition among various herds of deep- and shallow-snow caribou, captive deep-snow caribou from the Revelstoke maternity pen, and semi-domesticated reindeer. Our results confirm that free-ranging deep-snow caribou specialise on the arboreal hair lichens Bryoria and Nodobryoria, and we show that this correlates with a microbiome distinct from that of shallow-snow caribou specialising on the terrestrial lichens Cladonia and Stereocaulon. We also show that maternity penning of deep-snow caribou significantly altered forage consumption and microbiome composition: penned caribou consumed more foliose lichens and had a distinct microbiome compared to free-ranging caribou. Our results suggest that managers should carefully consider the preferred forage of caribou populations when designing interventions that require diet modification. We further suggest that faecal samples of caribou and other dietary specialists be routinely monitored for diet and microbiome composition, especially during periods of captivity or diet modification, as an additional component of conservation assessments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».