Extent of N-glycosylation of the metalloproteinase inhibitor and cytokine TIMP-1 determines pancreatic cancer cell proliferation and survival via CD63
Notice bibliographique
Résumé
Glycosylation emerges as a critical determinant of protein function in cancer, yet its impact on multifunctional secreted factors remains understudied. Here, we identified tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1), a glycoprotein with glycosylation sites at N30 and N78 harboring both a canonical anti-proteolytic and non-canonical cytokine-like activity, as one of the most-upregulated secreted glycoproteins circulating in the blood of pancreatic cancer (PC) patients. Whereas plasma from healthy donors contained similar amounts of double- (TIMP-1 glyc1/1 ), single-(N78 and not N30) (TIMP-1 glyc0/1 ), and non-glycosylated (TIMP-1 glyc0/0 ) TIMP-1, TIMP-1 glyc1/1 predominated in plasma from PC patients. scRNAseq and in vitro validation linked this shift to tumor progression-associated upregulation of the oligosaccharyltransferase (OST)-complex in epithelial cells. In human PC cell lines, OST complex activity was critical for synthesis of TIMP-1 glyc1/1 . Importantly, tumor cell-survival and proliferation-promoting activity via CD63 were dependent on TIMP-1 glycosylation, which required N30-glycosylation. In contrast, glycosylation was not necessary for the anti-proteolytic activity of TIMP-1 towards different matrix metalloproteinases (MMPs) (collagenases MMP-1, MMP-8; gelatinases MMP-2, MMP-9; stromelysin MMP-3; Matrilysin MMP-7) but modulated the respective inhibitory efficacy. Analysis of a published glycoproteome data set, allowing assessment of individual glycosylation site occupancy in TIMP-1, revealed that N30 site occupation correlated with poor survival, while N78 site occupation showed no prognostic value, corroborating the impact of double-glycosylation of TIMP-1, as observed in patients, on tumor-promotion. The glycosylation-dependent modulation of the multifunctionality of tumor-secreted TIMP-1 thus provide a molecular basis for its long-debated cancer-promoting role. Finally, it exemplifies the impact of glycosylation macroheterogeneity on disease-relevant modulation of protein function.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».