MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410218279 · doi:10.1021/acs.biomac.5c00097

Applying Computational Protein Design to Engineer Affibodies for Affinity-controlled Delivery of Vascular Endothelial Growth Factor and Platelet-Derived Growth Factor

2025· article· en· W4410218279 sur OpenAlexafffund
Justin E. Svendsen, Madeleine R. Ford, Chandler L. Asnes, Sang Cheul Oh, Jonathan Dorogin, Karly M. Fear, Johnathan R. O’Hara-Smith, Lauren O. Chisholm, Sophia R. Phillips, Michael J. Harms, Parisa Hosseinzadeh, Marian H. Hettiaratchi

Notice bibliographique

RevueBiomacromolecules · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensImpact
Organismes subventionnairesDivision of Graduate EducationNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of OregonOregon Health and Science UniversityNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésGrowth factorChemistryVascular endothelial growth factorCell biologyBiochemistryPlatelet-derived growth factorPlateletVascular endothelial growth factor ABiophysicsBiologyImmunologyVEGF receptorsCancer researchPlatelet-derived growth factor receptorReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vascular endothelial growth factor (VEGF) and platelet-derived growth factor (PDGF) play coordinated roles in angiogenesis. However, current biomaterial delivery vehicles for these proteins have a limited ability to precisely control the kinetics of protein release, preventing systematic exploration of their temporal effects. Here, we combined yeast surface display and computational protein design to engineer eight VEGF-specific and PDGF-specific protein binders called affibodies with a broad range of affinities for controlled protein release. Soluble affibodies modulated protein bioactivity as evidenced by changes in VEGF-induced endothelial cell proliferation and luminescent output of a PDGF-responsive cell line. Affibody-conjugated hydrogels enabled tunable protein release over 7 days. VEGF and PDGF released from affibody-conjugated hydrogels exhibited higher bioactivity than proteins released from hydrogels without affibodies, suggesting that these engineered affinity interactions could prolong protein bioactivity. This work underscores the power of computational protein design to enhance biomaterial functionality, creating a platform for tunable protein delivery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,952

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiomacromoleculesMême sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies ResearchTravaux en français237 207