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Enregistrement W4410229875 · doi:10.1073/pnas.2419691122

The developmental factor TBX3 engages with the Wnt/β-catenin transcriptional complex in colorectal cancer to regulate metastasis genes

2025· article· en· W4410229875 sur OpenAlexaff
Amaia Jauregi‐Miguel, Simon Söderholm, Tamina Weiss, Anna Nordin, Valeria Ghezzi, Salome M. Brütsch, Pierfrancesco Pagella, Yorick van de Grift, Gianluca Zambanini, Jacopo Ulisse, Ruslan Deviatiiarov, Elena Faustini, Lavanya Moparthi, Wenjing Zhong, Bergþór Björnsson, Per Sandström, Erik Lundqvist, Francisca Lottersberger, Stefan Koch, Andreas E. Moor, Eleonore von Castelmur, Claudio Cantù

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensEngineering Link (Canada)
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseSwedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher EducationJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyCancerfondenAdditional Ventures
Mots-clésWnt signaling pathwayBiologyTranscription factorCateninCancer researchChromatinMetastasisBeta-cateninColorectal cancerCell biologyLRP5GeneticsGeneSignal transductionCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wnt signaling orchestrates gene expression in a plethora of processes during development and adult cell homeostasis via the action of nuclear β-catenin. Yet, little is known about how β-catenin generates context-specific transcriptional outcomes. Understanding this will reveal how aberrant Wnt/β-catenin signaling causes neoplasia specifically of the colorectal epithelium. We have previously identified the transcription factor TBX3 as a tissue-specific component of the Wnt/β-catenin nuclear complex during mouse forelimb development. In this study, we show that TBX3 is functionally active in human colorectal cancer (CRC). Here, genome-wide binding and transcriptomics analyses reveal that TBX3 regulates cancer metastasis genes in cooperation with Wnt/β-catenin. Proteomics proximity labeling performed across Wnt pathway activation shows that TBX3 engages with several transcription factors and chromatin remodeling complexes found at Wnt responsive elements (WRE). Protein sequence and structure analysis of TBX3 revealed short motifs, including an exposed Asn-Pro-Phe (NPF), that mediate these interactions. Deletion of these motifs abrogates TBX3's proximity to its protein partners and its ability to enhance the Wnt-dependent transcription. TBX3 emerges as a key modulator of the oncogenic activity of Wnt/β-catenin in CRC, and its mechanism of action exposes protein-interaction surfaces as putative druggable targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,231
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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