MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410237708 · doi:10.1016/j.cirep.2025.200227

The use of a whole gut sac perfusion model to study the ex vivo inflammatory response of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) to lipopolysaccharide

2025· article· en· W4410237708 sur OpenAlexafffund
Shayne J. Oberhoffner, Stephanie J. DeWitte‐Orr, Paul M. Craig

Notice bibliographique

RevueComparative Immunology Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of WaterlooWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRainbow troutEx vivoLipopolysaccharideTroutInflammatory responseIn vivoBiologyFish <Actinopterygii>ChemistryFisheryInflammationImmunologyBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ex vivo studies provide a valuable opportunity to study organ-level effects of a compound in an isolated system. As all vertebrate cells can mount an innate immune response, it is important to study the cumulative immune response of multiple cell types that remain in their natural conformation, proportions, and polarity; something that in vitro studies cannot fully provide. This study proposes a simplified static “tie-bag” perfusion model to study the short-term immunological stimulation of rainbow trout middle and distal intestine by Fluorescein isothiocyanate (FITC) tagged lipopolysaccharide (LPS), a component of the gram-negative bacteria cell wall. Middle intestinal segments perfused with 200µg/ml FITC-LPS demonstrated significant increases in the expression of type-I interferon 1 (IFN-1) and tumor necrosis factor alpha (TNF-α) transcripts, while distal intestinal perfusions demonstrated significant increases in TNF-α and interleukin 1β (IL-1β) transcript levels. While FITC-LPS distribution could not be visualized due to overlap with tissue autofluorescence, tissues appeared to only experience minor epithelial sloughing. Overall, this method can be used to evaluate organ-level immune stimulation of antigens while maintaining tissue composition that permits histological examination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueComparative Immunology ReportsMême sujetAquaculture disease management and microbiotaTravaux en français237 207