MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4410251593 · doi:10.1038/s41467-025-59677-3

Structural basis of TMPRSS11D specificity and autocleavage activation

2025· article· en· W4410251593 sur OpenAlexafffund
Bryan J. Fraser, Ryan P. Wilson, Sára Ferková, Olzhas Ilyassov, Jackie Lac, Aiping Dong, Yen-Yen Li, Alma Seitova, Yanjun Li, Zahra Hejazi, Tristan M. G. Kenney, Linda Z. Penn, A.M. Edwards, Richard Leduc, Pierre‐Luc Boudreault, Gregg B. Morin, François Bénard, C.H. Arrowsmith

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensBC Cancer FoundationCanada's Michael Smith Genome Sciences CentrePrincess Margaret Cancer CentreUniversity of British ColumbiaSpinal Cord Injury BCUniversité de SherbrookeStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenentechMitacsKillam TrustsWellcome TrustOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaANational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesOntario GenomicsGenome CanadaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBayerNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Light SourcePfizer
Mots-clésProteasesProteaseSerine proteaseTMPRSS2CleaveSerineChemistrySubtilisinMASP1Transmembrane proteinBiochemistryComputational biologyCell biologyBiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)EnzymeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transmembrane Protease, Serine-2 (TMPRSS2) and TMPRSS11D are human proteases that enable SARS-CoV-2 and Influenza A/B virus infections, but their biochemical mechanisms for facilitating viral cell entry remain unclear. We show these proteases spontaneously and efficiently cleave their own zymogen activation motifs, activating their broader protease activity on cellular substrates. We determine TMPRSS11D co-crystal structures with a native and an engineered activation motif, revealing insights into its autocleavage activation and distinct substrate binding cleft features. Leveraging this structural data, we develop nanomolar potency peptidomimetic inhibitors of TMPRSS11D and TMPRSS2. We show that a broad serine protease inhibitor that underwent clinical trials for TMPRSS2-targeted COVID-19 therapy, nafamostat mesylate, was rapidly cleaved by TMPRSS11D and converted to low activity derivatives. In this work, we develop mechanistic insights into human protease viral tropism and highlight both the strengths and limitations of existing human serine protease inhibitors, informing future drug discovery efforts targeting these proteases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature Communications→Même sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 Research→Travaux en français237 207→