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Enregistrement W4410260831 · doi:10.1002/gcc.70050

Novel <i>ACTB::FER</i> Promoter Swap Fusion Characterizes Rare Superficial Myoid/Myofibroblastic Tumors

2025· article· en· W4410260831 sur OpenAlexaff
Patrick R. Blackburn, Mohammad K. Eldomery, Victor Pastor Loyola, Zonggao Shi, Anthony Arnoldo, Faizan Malik, Teresa Santiago, Rose Chami

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSoft tissue tumor case studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesSt. Jude Children's Research Hospital
Mots-clésBiologyFusion geneCancer researchDesminGenePathologyImmunohistochemistryGeneticsMedicineVimentinImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pediatric fibroblastic, myofibroblastic, and myoid tumors encompass several entities, many with characteristic gene fusions that are now emerging as molecularly defined tumor groups. Here, we present two cases of spindle cell neoplasms with novel ACTB::FER promoter swap fusions. Both tumors presented in the extremities of pediatric patients (9-year-old and 6-year-old females) as superficial skin nodules with slow growth. Histologically, both tumors showed monomorphic spindle cell proliferation in short fascicles, but without significantly increased mitotic activity, high-grade atypia, or necrosis. Both cases showed diffuse positivity for SMA with patchy desmin expression. RNA sequencing confirmed fusion breakpoints, revealing transcriptional upregulation of FER. Neither patient has had evidence of interval growth or recurrence to date. While the biological significance of ACTB::FER fusions remains unclear, their recurrence and the absence of other clear oncogenic drivers suggest a distinct molecular pathway that may define a novel entity. Fusions of ACTB and FER genes with different partners have been observed in rare aggressive mesenchymal tumors; however, the ACTB::FER promoter swap fusion is currently unrecognized in soft tissue tumors. We report the first two cases of soft tissue tumors harboring ACTB::FER fusions and expand the molecular spectrum of mesenchymal tumors with kinase gene alterations. Further, we highlight the importance of target-agnostic approaches for the detection of rare kinase fusions, which may not be included on targeted next-generation sequencing panels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,637
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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