Epigenetic Age as Both Effect and Modifier of Response to Nasal Corticosteroid Under Diesel Exhaust and Allergen Exposure in Adults With Allergic Rhinitis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rationale: Allergic rhinitis (AR) is a nasal inflammatory disease triggered by exposure to aeroallergens. Exposure to air pollution, including diesel exhaust (DE; a model of traffic-related air pollution) can drive allergic rhinitis (AR) and may alter airway DNA methylation. Nasal corticosteroids (NCS) are anti-inflammatory agents used as first-line treatment for AR, and in vitro studies have also shown budesonide to modulate DNA methylation. The effect of budesonide treatment, in combination with exposures to DE and allergens, on DNA methylation-based biomarkers of age in AR has not been previously studied. Methods: In a double-blinded crossover trial, twenty healthy non-smokers (aged 18-65) with AR used a once-daily budesonide or placebo nasal spray treatment for four weeks each in a randomized order. Allergen and DE exposures were completed twice over two-day periods separated by a ≥2-week washout, starting with allergen two weeks after the start of each treatment arm. A ≥4-week washout was completed between treatment arms. Nasal brushings were collected at the start of each treatment period, as well as before and at 24h and 48h after the initial allergen or DE exposure in each treatment arm. Re-exposures occurred 24h after each initial exposure. Allergen challenges were titrated for each participant, while 2h DE exposures were standardized to 300μg/m3 of PM2.5. DNA methylation was quantified using Illumina EPIC arrays and epigenetic age measurements were computed by the Clock Foundation. Data analysis was completed using linear mixed effects models. Results: The effects of budesonide treatment on various measures of epigenetic age at each timepoint are given in Table 1. Allergen increased Horvath1 age acceleration (AA) following initial (2.58 years [0.29, 4.86], p=0.03) and re-exposure (3.35 years [1.03, 5.56], p=0.006), while decreasing Grim AA (-2.10 years [-3.36, -0.85], p≤0.001) following re-exposure. Re-exposure to DE also decreased Grim AA (-1.33 years [-2.48, -0.19], p=0.02). Grim AA scores moderated budesonide's effect on IL-1β (β=1.20-fold [1.09, 1.32], p=0.02) and VEGF-A (β=1.07-fold [1.03, 1.12], p=0.03) relative to placebo at the DE baseline, as well as an increase in DE's effect upon GM-CSF (β=1.12-fold [1.04, 1.21], p=0.03) and IL-16 (β=1.15-fold [1.06, 1.26], p=0.03) 24h after re-exposure to DE. Conclusions: Budesonide and exposure to allergen and DE significantly affected epigenetic age acceleration. Epigenetic age may moderate cytokine responses to budesonide treatment and common environmental exposures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».