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Enregistrement W4410273924 · doi:10.1136/jmg-2025-110638

UK clinical practice guidelines for the management of patients with constitutional <i>POT1</i> pathogenic variants

2025· article· en· W4410273924 sur OpenAlexaff
Olga Tsoulaki, D Gareth Evans, Neil Rajan, Farah Bakr, Helen Hatcher, Andrea Napolitano, Sunil Iyengar, Aslam Sohaib, Claire Forde, Emma R. Woodward, Terri McVeigh, Marc Tischkowitz, Fiona Lalloo, Helen Hanson

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesManchester Biomedical Research CentreCancer Research UK
Mots-clésLi–Fraumeni syndromeMedicineCancerBiologyGermline mutationGeneticsInternal medicineMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Constitutional or germline pathogenic variants (GPVs) in protection of telomeres 1 (POT1 ) are associated with a variety of tumours resulting in the recognition of POT1-tumour predisposition syndrome (POT1-TPDS). These tumours may include cutaneous melanoma, angiosarcoma, haematological malignancy and brain tumours. Due to the rarity of POT1 GPVs and limited available data, the overall lifetime cancer risks for individuals with POT1-TPDS are unclear. Furthermore, there is scant evidence to support the role of surveillance in early cancer detection in this patient group. A recent international publication suggested a surveillance protocol similar to that used in Li-Fraumeni Syndrome (LFS) could be offered to POT1 pathogenic variant carriers, particularly where there are LFS-like features. However, current evidence for POT1-TPDS is not supportive of an equivalent lifetime cancer risk. Given the inclusion of POT1 in the National Test Directory in England and the need for UK-based guidance, an expert group undertook a literature review to assess the phenotypic spectrum of POT1-TPDS and to provide lifetime risk estimates of POT1 -associated cancers. The available evidence was shared with a small working group of experts that included clinical geneticists, dermatologists, sarcoma specialists, haematologists and radiologists to cover all aspects of the cancers most commonly associated with POT1-TPDS. Following structured expert group discussions, we achieved consensus on best practice recommendations for a POT1-TPDS UK management protocol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,071
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,125

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,071
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0040,005
Intégrité de la recherche0,0100,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0370,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,413
Écart entre enseignants0,351 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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