NFE2L3 regulates inflammation and oxidative stress-related genes in the colon
Notice bibliographique
Résumé
The molecular mechanisms leading to inflammatory bowel disease (IBD) are only partially understood. We investigated the role of the transcription factor NFE2L3 in a mouse model of colitis by inducing inflammation using dextran sodium sulfate (DSS). We confirmed the presence of inflammation by histological analysis and elevated levels of the inflammation marker lipocalin-2 (LCN2) in the stool. We found that Lcn2 transcript levels are significantly less elevated in Nfe2l3 −/− mice than wild type mice. We further showed a reduction of Nfe2l3 mRNA, in wildtype mice upon DSS treatment. We cross referenced ENCODE ChIP data of NFE2L3 binding partners MAFF and MAFK with known IBD and DSS effectors and identified Stat1 , Hmox1 , and Slc7a11 as potential NFE2L3 targets. These proteins are induced during colitis to suppress the immune response, reduce oxidative stress, and trigger ferroptosis, respectively. We analyzed the candidate targets and observed an increase in their protein expression upon DSS treatment in wild type but not in Nfe2l3 −/− mice. Furthermore, in the absence of DSS, we observed an increase in the basal levels of pSTAT1 and SLC7A11 proteins in Nfe2l3 −/− mice. These data suggest that the NFE2L3 transcription factor primes the microenvironment towards a pro-inflammatory ready state during inflammatory bowel disease (IBD).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».