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Enregistrement W4410278135 · doi:10.1016/j.bbamcr.2025.119987

NFE2L3 regulates inflammation and oxidative stress-related genes in the colon

2025· review· en· W4410278135 sur OpenAlexafffund
Linda Yaker, James Saliba, Palak Gujral, E. Alonso, Xingyue Yan, Volker Blank

Notice bibliographique

RevueBiochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research · 2025
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAnesthesia and Neurotoxicity Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesLady Davis Institute for Medical ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOxidative stressInflammationGeneOxidative phosphorylationCell biologyBiologyGeneticsImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular mechanisms leading to inflammatory bowel disease (IBD) are only partially understood. We investigated the role of the transcription factor NFE2L3 in a mouse model of colitis by inducing inflammation using dextran sodium sulfate (DSS). We confirmed the presence of inflammation by histological analysis and elevated levels of the inflammation marker lipocalin-2 (LCN2) in the stool. We found that Lcn2 transcript levels are significantly less elevated in Nfe2l3 −/− mice than wild type mice. We further showed a reduction of Nfe2l3 mRNA, in wildtype mice upon DSS treatment. We cross referenced ENCODE ChIP data of NFE2L3 binding partners MAFF and MAFK with known IBD and DSS effectors and identified Stat1 , Hmox1 , and Slc7a11 as potential NFE2L3 targets. These proteins are induced during colitis to suppress the immune response, reduce oxidative stress, and trigger ferroptosis, respectively. We analyzed the candidate targets and observed an increase in their protein expression upon DSS treatment in wild type but not in Nfe2l3 −/− mice. Furthermore, in the absence of DSS, we observed an increase in the basal levels of pSTAT1 and SLC7A11 proteins in Nfe2l3 −/− mice. These data suggest that the NFE2L3 transcription factor primes the microenvironment towards a pro-inflammatory ready state during inflammatory bowel disease (IBD).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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