Formation of the β-sheet at the extracellular opening of the intimin β-barrel domain is necessary for stability and efficient passenger secretion
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Attaching and effacing pathogens, such as enteropathogenic and enterohaemorrhagic E. coli , rely on an adhesin, intimin, for attachment to enterocytes and downstream effects leading to actin pedestal formation. Intimin belongs to the inverse autotransporter family (type 5e secretion systems), which secrete the extracellular adhesive domain or passenger via a hairpin intermediate. While many of the next steps in secretion are now understood, how the hairpin initially forms is not known. We sought to investigate this by making point mutations at several positions in the β-barrel domain of intimin, as this domain forms at least part of the secretion pore. We made the mutations in a wild-type background and in a stalled intermediate caught in the hairpin conformation, which allowed us to uncouple passenger secretion from hairpin formation. Surprisingly, most of the point mutations did not have an appreciable effect on hairpin formation or passenger secretion, and larger changes such as replacing the entire linker region with a flexible glycine-serine stretch showed only a modest reduction in passenger secretion. By contrast, mutations affecting a small β-sheet at the extracellular face of the intimin β-barrel between two extracellular loops and the C-terminus of the linker had a more pronounced effect on secretion, and abolishing this β-sheet prevented hairpin formation and led to complete loss of the wild-type protein. Our results show that the intimin β-barrel is remarkably tolerant to changes and that the β-sheet on the extracellular side of this domain plays a central role in passenger secretion and protein stability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».