Drug delivery process simulation—Quantifying the conformation dynamics of paclitaxel and cremophor EL
Notice bibliographique
Résumé
Paclitaxel is a highly successful anti-neoplastic cancer drug. The first clinically successful paclitaxl-delivery method is a mixture with cremophor EL and ethanol, here termed the taxol micelle. Until now, molecular dynamics analysis has not been presented to quantify the structural and conformation properties of these drug molecules when interacting with each other to create this nonstandard micelle. Here we apply systematic molecular simulation and statistical analysis of paclitaxel and cremophor EL conformations based on all atom and coarse-grained approaches. The cremophor EL in the taxol micelle showed a clustering network in a 3D landscape where paclitaxel can be loaded at much higher than standard concentration with no aggregation. Paclitaxel particles within the cremophor EL cavities showed some oscillatory behaviour due to a repeated adsorption/desorption with the surrounding network. Paclitaxel conformations at the lowest energy state can be described when the side-chain phenyl rings are closer relative to the immobile core. Cremophor EL molecules reached the highest energy state when wings were fully spread and at the lowest energy state when wings were fully closed. The spiral shapes were observed to be the dominant species in the cremophor EL population. We then established reliable statistical correlations between molecular conformations and the energy states. Our reliable all atom and coarse-grained modelling approach can also be applied for effective drug design analysis using different drug delivery systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».