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Enregistrement W4410312141 · doi:10.1080/21505594.2025.2503429

A RACK1 family protein regulates pathogenicity of <i>Peronophythora litchii</i> by acting as a scaffold for MAPK signal modules

2025· article· en· W4410312141 sur OpenAlexaff
Guanghui Kong, Rui Li, Weixiong Huang, Yaowen Yang, Tianfang Guan, Jinghan Liu, Wen Li, Tom Hsiang, Pinggen Xi, Minhui Li, Zide Jiang

Notice bibliographique

RevueVirulence · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyScaffold proteinPathogenicityMAPK/ERK pathwayCell biologyScaffoldSignal transductionSIGNAL (programming language)Signal transducing adaptor proteinMicrobiologyGeneticsEngineeringComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Litchi downy blight caused by Peronophythora litchii is the most destructive disease of litchi (Litchi chinensis). RACK1 (Receptor for activated C kinase 1) is a group of scaffold proteins, mainly involved in the regulation of various signaling pathways by interacting with signal transduction proteins and affecting the activity of these proteins. In this study, a RACK1 homologue identified in P. litchii, and named PlRACK1. The protein was found to interact with the mitogen-activated protein kinases, PlMAPK1 and PlMAPK2. CRISPR/Cas9-mediated genome editing technology was used to knock out PlRACK1, and we found that it was involved in mycelial growth, cell wall integrity, ROS metabolism, laccase activity, and pathogenicity of P. litchii. PlMAPK1 interacted with RACK1, and they jointly regulated sporangiophore branching of P. litchii. Transcriptome analysis showed that P. litchii MAPK Phosphatase 1 (PlMKP1) and beta-glucoside (PlBglX) were regulated by PlRACK1, both of which were also required for the pathogenicity of P. litchii. As well, PlMKP1 also interacted with PlMAPK1 and PlMAPK2. These results provide insights into the direct interactions between RACK1, MAPKs, and MKP, and their functions in growth, development, and pathogenesis in a plant pathogenic oomycete.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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