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Enregistrement W4410315978 · doi:10.4269/ajtmh.24-0776

Differential Virulence and Host-Specific Fitness of Regionally Distinct Human-Derived Powassan Virus Lineage 2 Strains

2025· article· en· W4410315978 sur OpenAlexfundaboutno aff
Rachel Lange, Julia C. Pritchard, Anna S. Jaeger, Tyler D. Bold, Jennifer L. White, Amy B. Dean, Rene Hull, Kirsten St. George, Alan P. Dupuis, Matthew T. Aliota, Alexander T. Ciota

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Tropical Medicine and Hygiene · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity at AlbanyCenters for Disease Control and PreventionYork UniversityUniversity of PennsylvaniaNew York State Department of Health - Wadsworth CenterNew York State Department of HealthUniversity of MinnesotaNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBiologyVirologyVirulenceStrain (injury)TickCladeVirusGeneticsGenePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Powassan virus (POWV; family Flaviviridae) is a tick-borne encephalitic virus endemic to Canada, the United States, and Russia. In the United States, POWV is transmitted by ixodid ticks, and transmission foci reflect the geographic range of these vectors, primarily Ixodes scapularis. Thus, northeastern and midwestern regions of the United States contain the highest human case burdens and prevalence of infected ticks. Notably, New York (NY) and Minnesota (MN) have a long history of POWV transmission to humans. Over time, genetic divergence has occurred in these regions, giving rise to distinct midwestern and northeastern clades. Despite the established circulation of POWV, increases in reported human cases, and documented genetic distinction, an understanding of strain-specific POWV virulence is limited because of the lack of human isolates. In 2020 and 2021, two POWV strains were isolated from fatal human cases from MN (deer tick virus [DTV] MN-PV320) and NY (DTV NY21-027). Here, we provide the first characterization of geographically distinct, contemporary, human POWV isolates. Comprehensive genetic characterization was completed and phenotypic variability was determined in vitro and in vivo . Although strain fitness was similar in I. scapularis, higher mortality rates were measured in a susceptible POWV mouse model after infection with DTV NY21-027 compared with DTV MN-PV320. Genetic analysis revealed several variable amino acid substitutions, including I2173L in DTV NY21-027, which was selected for in all strains after neurological infection. These data suggest that genetic divergence of POWV strains from regionally distinct transmission foci could contribute to strain-dependent pathogenic potential in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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