Differential Virulence and Host-Specific Fitness of Regionally Distinct Human-Derived Powassan Virus Lineage 2 Strains
Notice bibliographique
Résumé
Powassan virus (POWV; family Flaviviridae) is a tick-borne encephalitic virus endemic to Canada, the United States, and Russia. In the United States, POWV is transmitted by ixodid ticks, and transmission foci reflect the geographic range of these vectors, primarily Ixodes scapularis. Thus, northeastern and midwestern regions of the United States contain the highest human case burdens and prevalence of infected ticks. Notably, New York (NY) and Minnesota (MN) have a long history of POWV transmission to humans. Over time, genetic divergence has occurred in these regions, giving rise to distinct midwestern and northeastern clades. Despite the established circulation of POWV, increases in reported human cases, and documented genetic distinction, an understanding of strain-specific POWV virulence is limited because of the lack of human isolates. In 2020 and 2021, two POWV strains were isolated from fatal human cases from MN (deer tick virus [DTV] MN-PV320) and NY (DTV NY21-027). Here, we provide the first characterization of geographically distinct, contemporary, human POWV isolates. Comprehensive genetic characterization was completed and phenotypic variability was determined in vitro and in vivo . Although strain fitness was similar in I. scapularis, higher mortality rates were measured in a susceptible POWV mouse model after infection with DTV NY21-027 compared with DTV MN-PV320. Genetic analysis revealed several variable amino acid substitutions, including I2173L in DTV NY21-027, which was selected for in all strains after neurological infection. These data suggest that genetic divergence of POWV strains from regionally distinct transmission foci could contribute to strain-dependent pathogenic potential in humans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».