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Enregistrement W4410353447 · doi:10.1101/2025.05.14.654002

Lipid scrambling via TMEM16F mediates the formation and release of apoptotic vesicles

2025· preprint· en· W4410353447 sur OpenAlexafffund
Trieu Le, Yu Meng Li, Amra Sarić, Joost C. M. Holthuis, Sergio Grinstein, Spencer A. Freeman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensSickKids FoundationMental Health Research CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchDalhousie UniversityDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésScramblingVesicleChemistryCell biologyApoptosisBiophysicsMicrovesiclesBiochemistryBiologyComputer sciencemicroRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The ubiquitous and highly conserved programmed cell death pathways that are essential for tissue development and homeostasis are accompanied by distinct morphological alterations. Apoptotic cells undergo fragmentation that is concomitant with the exposure of phosphatidylserine (PS) on the membrane surface. Large fragments, called apoptotic bodies, as well as much smaller and more numerous vesicles are released. While the molecular mechanisms underlying apoptotic body formation have been explored, much less is known about vesicle biogenesis. We used an inducible, active form of TMEM16F to determine the role of lipid scrambling in vesiculation, separately from other apoptotic signaling events. Plasmalemmal lipid scrambling sufficed to release apoptotic-like vesicles without causing changes in cytosolic calcium or the submembrane cytoskeleton. The scrambled bilayer showed pronounced segregation of exofacial lipids and redistribution of apparent cholesterol to the inner leaflet. The clustering of raft-associated components with bulky headgroups –typified by glycophosphatidylinositol-linked proteins– formed domains of outward (convex) curvature, while regions of accumulation of phosphatidylethanolamine (PE) generated inward (concave) curvature that facilitated the scission of vesicles. Thus, scrambling of plasma membrane lipids suffices to induce regions of acute membrane curvature and facilitates detachment of vesicles analogous to those released from the surface of apoptotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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