Population genetics of the endangered narrowly endemic Island Marble butterfly ( <i>Euchloe ausonides insulanus</i> )
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Island Marble butterfly ( Euchloe ausonides insulanus ) is an endangered species endemic to the San Juan Islands off the coast of Washington State, United States, and British Columbia, Canada. The species was thought to be extinct for ∼90 years before it was rediscovered at American Camp, San Juan Island National Historical Park in 1998. Here, we report the results of the first population genetic analyses for insulanus , using DNA collected non-invasively from individuals in the last known stronghold for the species. We used DNA extracted from meconium, larval exuviae, and natural mortalities to generate and test thirteen new microsatellite markers to estimate genetic diversity, population structure, and kinship. We assembled and annotated mitochondrial genomes, which were used alongside museum specimens of insulanus collected ∼100 years ago from Vancouver Island, and other members of the E. ausonides species complex, to infer the evolutionary history of the species. The results indicated that insulanus experiences low heterozygosity, a small effective population size (N e ), and low allelic diversity. High levels of inbreeding were found in some individuals, but inbreeding was uneven across the population. No population structure or partitioning of genetic variation by host plant was detected. The mitogenomes of extant insulanus were all identical and modern samples showed a loss of allelic diversity compared to insulanus from museums. Extant insulanus formed a clade with museum specimens and we identified multiple putatively diagnostic alleles to differentiate insulanus from other subspecies. Based on these results, we outline considerations for species management and genetic monitoring.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».