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Enregistrement W4410384564 · doi:10.1016/j.eti.2025.104267

Advancing bio-recycling of nylon monomers through CRISPR-assisted engineering

2025· article· en· W4410384564 sur OpenAlexafffund
Bahareh Sadat Arab, jinjin chen, Anna N. Khusnutdinova, C. Perry Chou, Yilan Liu

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Technology & Innovation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Waterloo
Mots-clésCRISPRMonomerPolymer scienceBiochemical engineeringBiotechnologyChemistryEngineeringBiologyOrganic chemistryPolymerBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plastic waste is a global environmental crisis, and nylon—a widely used polyamide—contributing significantly due to its extensive applications in textiles, automotive components, and packaging. Post-lifecycle degradation of nylon releases monomers like 1,6-hexamethylenediamine (HD) and 6-aminocaproic acid (ACA), which persist in ecosystems, posing toxicity and bioaccumulation risks. In this study, we employed a CRISPR-assisted directed evolution (CDE) to engineer Pseudomonas putida KT2440 for efficient utilization of HD as the sole nitrogen source, coupling its degradation to bacterial growth. Genomic and transcriptomic analyses prioritized potential enzymes involved in HD degradation. Using CRISPR interference (CRISPRi) and expert-guided screening, we identified three key enzymes including KgtP transporter, AlaC transaminase, and FrmA dehydrogenase that are critical to the KAF pathway. The functionality of these enzymes was confirmed in P. putida and further validated through heterologous expression in Escherichia coli . The CDE and growth-coupled strategy, together with the KAF pathway we discovered, is essential for our future efforts to engineer synthetic bacterial consortia capable of degrading mixed plastic monomers. In the long term, we envision integrating these consortia with synthetic biology tools to degrade complex plastic polymers and convert them into valuable chemicals, advancing circular economic efforts for sustainable plastic waste management and environmental protection. Synopsis CRISPR systems engineered Pseudomonas putida for efficient nylon monomer degradation, unveiling a novel pathway and advancing plastic waste recycling and environmental mitigation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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