Deep3BPP: Identification of Blood–Brain Barrier Penetrating Peptides Using Word Embedding Feature Extraction Method and CNN-LSTM
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
To prevent different chemicals from entering the brain, the blood-brain barrier penetrating peptide (3BPP) acts as a vital barrier between the bloodstream and the central nervous system (CNS). This barrier significantly hinders the treatment of neurological and CNS disorders. 3BPP can get beyond this barrier, making it easier to enter the brain and essential for treating CNS and neurological diseases and disorders. Computational techniques are being explored because traditional laboratory tests for 3BPP identification are costly and time-consuming. In this work, we introduced a novel technique for 3BPP prediction with a hybrid deep learning model. Our proposed model, Deep3BPP, leverages the LSA, a word embedding method for peptide sequence extraction, and integrates CNN with LSTM (CNN-LSTM) for the final prediction model. Deep3BPP performance metrics show a remarkable accuracy of 97.42%, a Kappa value of 0.9257, and an MCC of 0.9362. These findings indicate a more efficient and cost-effective method of identifying 3BPP, which has important implications for researchers in the pharmaceutical and medical industries. Thus, this work offers insightful information that can advance both scientific research and the well-being of people overall.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle