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Enregistrement W4410404981 · doi:10.1093/jas/skaf171

Characterizing the seminal microbiota in mature rams managed on divergent planes of nutrition, and their male offspring

2025· article· en· W4410404981 sur OpenAlexaff
Justine Kilama, Devin B. Holman, Kerri A Bochantin-Winders, Jennifer L Hurlbert, Friederike Baumgaertner, C. S. Schauer, Carl R Dahlen, Samat Amat

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySemenBreedOffspringAnimal scienceDomestic sheep reproductionFertilitySpermAndrologyPhysiologyGeneticsPopulationPregnancyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidence suggests that there is a rich and diverse microbial community in the semen of mammals, which may be important in reproductive health and fertility. However, the composition of ram seminal microbiota remains under-characterized, with factors shaping it still largely unknown. The objectives of this study were to; 1) characterize the seminal microbiota of mature rams and their ram lambs using 16S rRNA gene sequencing; 2) evaluate whether managing the mature rams on divergent planes of nutrition can influence their seminal microbiota and that of their male offspring; and 3) compare the seminal microbiota between mature rams and ram lamb cohorts to identify age-related microbiota characteristics. For this, mature rams (n = 24) were assigned to one of the 3 nutritional planes: 1) Positive (POS), to gain 12% of initial body weight (BW) (n = 8), 2) maintenance (MAINT), to maintain BW (n = 8), and 3) negative (NEG), to lose 12% BW (n = 8) over an 84-d period. Semen samples were collected from the mature rams (F0) after 28-d, 56-d, and 84-d from the start of the trial. Following the 84-d period, the 24 rams were used to breed 240 mature ewes over 28-d. After lambing, the ram lambs (F1) sired by POS, MAINT, and NEG rams were maintained on the same diet until 11 months of age, at which semen samples were collected. Genomic DNA was extracted from the semen, and the microbiota was analyzed using 16S rRNA gene (V3-V4) sequencing. Overall, there was a relatively diverse and dynamic bacterial microbial community in the ram semen, mainly dominated by Actinobacteriota, Bacillota, Bacteroidota, and Proteobacteria phyla. The predominant genera identified included Fastidiosipila, Corynebacterium, Trueperella, Arthrobacter, Dietzia, and Bifidobacterium. The seminal microbial community structure, composition, and alpha diversity of F0 rams was influenced by diet during the first 28-d, but these diet influences later diminished. The paternal plane of nutrition did not influence the seminal microbiota of offspring ram lambs. The mature rams and ram lambs had distinct seminal microbiota, with young rams showing greater microbial richness and diversity (P < 0.005). Our results suggest that there is a relatively diverse and dynamic microbial community present in the semen of both mature rams and ram lambs, and that this microbiota is transiently influenced by diet and age. Managing rams on divergent planes of nutrition may not affect their offspring's seminal microbiota.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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