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Enregistrement W4410407332 · doi:10.1101/2025.05.15.653649

A genus-wide interaction atlas across NS4B orthologues identifies a conserved role for UFMylation in orthoflavivirus replication

2025· preprint· en· W4410407332 sur OpenAlexafffund
Sreejith Rajasekharan, Viviana Andrea Barragan Torres, Yago Côrtes Pinheiro Gomes, Lucas Wilken, Katharina Overhoff, Shunmoogum A. Patten, Satoru Watanabe, Laurent Chatel‐Chaix, Pietro Scaturro

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for Innovation
Mots-clésReplication (statistics)Atlas (anatomy)BiologyComputational biologyGenusGeneticsZoologyPaleontologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Orthoflavivirus infections represent an increasing public health burden, with several members of the genus emerging or re-emerging globally. Despite the availability of few vaccines, no antiviral drugs are currently licensed for the treatment of orthoflavivirus infections. Several pre-clinical studies identified the non-structural protein 4B (NS4B), one of the least characterized viral proteins within the orthoflavivirus genus, as the most promising target for the development of potent direct-acting antivirals. However, its functional roles in viral replication are still elusive. Here, we employ an integrated proteomic approach to systematically identify cellular targets of NS4B across eight prototypic orthoflaviviruses and characterize their influence on the human proteome. Using this approach, we mapped high-confidence NS4B-interacting human proteins across the genus, underlying potentially divergent mechanisms of host adaptation across orthoflaviviruses spanning diverse pathologies and vector preferences. Among these, we unveil a novel function for UBA5, the E1-activating enzyme of the UFMylation pathway, in orthoflavivirus replication. Mechanistically, we map associations of distinct viral proteins with multiple members of the UFMylation pathway, which are selectively recruited to sites of viral replication to promote mitochondrial respiration. Finally, we demonstrate that pharmacological inhibition of UFMylation exerts potent antiviral activity in vitro and in vivo . This integrative study provides a rational framework for a system-level understanding of orthoflavivirus NS4B effector functions and sheds light on a conserved and unconventional role for UFMylation in orthoflavivirus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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