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Enregistrement W4410425840 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-7x8hg

Designer Frankenproteins that Halt the Proliferation of Myc-driven Cancer Cells

2025· preprint· en· W4410425840 sur OpenAlexafffund
Mohamed Ashraf Ali, Raneem Akel, Francine He, Micheline Piquette‐Miller, Jumi A. Shin

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCancer Research Society
Mots-clésCancerCancer researchCancer cellBusinessCell biologyBiologyInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Overexpression of the Myc transcription factor is involved in >70% of cancers. Notably, younger women and Black women show higher rates of Myc-driven breast cancers, with 97% of breast tumors from Black women showing elevated levels of Myc. Myc partners with transcription factor Max to bind to the E-box DNA response element (CACGTG). We engineered frankenproteins MEF and MEF/C93, based on the basic region/helix-loop-helix/leucine zipper (bHLHZ) motif, that comprise modules from different protein familes. In bacterial one-hybrid assays and quantitative EMSA, both proteins bound the E-box with Kd values 8-10 nM, which rival native transcription factors. Western blot confirmed high Myc expression in Myc-dependent MDA-MB-231 triple-negative breast cancer cells. MEF and MEF/C93 disrupted the Myc/Max/E-box network in cellulo: cell viability assays revealed IC50 values 1-2 µM in MDA-MB-231 cells vs. ~25 µM IC50 values in Myc-independent MCF-7 breast cancer cells. Furthermore, qPCR showed that our proteins significantly reduced expression of Myc-target genes in MDA-MB-231, but not MCF-7 cells. These findings demonstrate that MEF-based proteins selectively inhibit the Myc/Max/E-box network in Myc-dependent cancer cells, thus offering a promising protein-based therapeutic approach for treating Myc-driven cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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