Similar Binding Mode of a 5-Sulfonylthiouracil Derivative Antagonist at Chemerin Receptors CMKLR1 and GPR1
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Several studies have linked chemerin/chemokine-like receptor 1 (CMKLR1) to inflammation, leukocyte recruitment, and obesity. Reduced cellular activation may reduce inflammation in adipose tissues. High-throughput screening identified a novel antagonist (VU0514009), which was optimized to compound 16 as a full and competitive antagonist (IC 50 = 37 μM). Mutagenesis studies elucidated relevant interactions of compound 16 at CMKLR1 residues Y6.51 and L7.35 as well as F7.31, S7.32, and T7.39 forming the binding pocket. Based on active CMKLR1/chemerin-9 structures and the inactive AlphaFold model, in silico docking was performed in the inactive model, with compound 16 most likely binding orthosterically. Considering the sequence similarity of CMKLR1 and GPR1, compound 16 was docked to GPR1, indicating a similar binding. At GPR1, compound 16 showed a slightly lower effect on chemerin-9-mediated arrestin recruitment and internalization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».