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Enregistrement W4410460867 · doi:10.1101/2025.05.16.654480

Bi-directional relationship between the biofilm of <i>Porphyromonas gingivalis</i> and the amyloid-beta peptide

2025· preprint· en· W4410460867 sur OpenAlexafffund
David Dumoulin, Mnar Ghrayeb, Daniel Garneau, Liraz Chai, Éric Frost, Tamàs Fülöp, Pascale B. Beauregard

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéMinistère des relations internationales et de la Francophonie
Mots-clésPorphyromonas gingivalisBiofilmBETA (programming language)Amyloid (mycology)PeptideMicrobiologyAmyloid betaChemistryBiologyBacteriaComputer scienceBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Periodontitis and Porphyromonas gingivalis infections are significant risk factors for the onset of Alzheimer’s disease (AD). Despite P. gingivalis relying on biofilm for its survival and virulence, the impact of the extracellular matrix on AD’s neuropathological hallmarks was never examined. In this study, we report a bidirectional relationship between the amyloid beta (Aβ) peptide, which plays a central role in AD, and the biofilm of P. gingivalis . Using multiple fluorescent markers for biofilm components, we observed that Aβ1-40 inhibited biofilm formation while Aβ1-42 increased extracellular matrix production. Also, using thioflavin T staining and atomic force microscopy, we observed co-aggregation between the biofilm and monomeric Aβ1-40, resulting in a quicker aggregation and significant changes in aggregate structures. Our findings propose mechanistic explanations for the role of P. gingivalis as a risk factor for AD and offer potential mechanisms for the microbial involvement in AD etiology. Importance While the etiology of Alzheimer’s disease has been studied extensively for the past 50 years, its exact causes remain unknown. Our current understanding is that the accumulation of multiple genetic and environmental risk factors would lead to the onset of the disease. Porphyromonas gingivalis is a bacterium that produces biofilm and elicits periodontitis, a chronic infection of the gums that constitutes a risk factor for Alzheimer’s disease. While studies have looked at the effects of P. gingivalis in triggering Alzheimer’s symptoms in animal models, none have explored the impact of the biofilm, which is ubiquitous to this bacterium. Our study seeks to bridge that gap by demonstrating a bi-directional relationship between the biofilm of P. gingivalis and amyloid beta, one of the brain lesions involved in Alzheimer’s. By understanding risk factors involved in Alzheimer’s and their impact, we hope to provide valuable knowledge on prevention and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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