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Enregistrement W4410461217 · doi:10.1101/2025.05.13.653790

Elephants inhabiting two forested sites in western Uganda exhibit contrasting patterns of species identity, density, and history of hybridization

2025· preprint· en· W4410461217 sur OpenAlexaff
Claire K. Goodfellow, Daniella E. Chusyd, Dennis Babaasa, Colin A. Chapman, Jena R. Hickey, Mireille Johnson, Charles Kayijamahe, Richard Mutegeki, Patrick A. Omeja, Charles Tumwesigye, Eustrate Uzabaho, Samuel K. Wasser, Michael D. Wasserman, Caitlin P. Wells, Nelson Ting

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWildlife Ecology and Conservation
Établissements canadiensVancouver Island University
Organismes subventionnairesNational Geographic Society
Mots-clésIdentity (music)GeographyEcologyBiologyArt

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Elephant populations across much of Africa face severe rates of decline due to poaching and habitat loss. The recent decision by the International Union for the Conservation of Nature (IUCN) to separately list African forest ( Loxodonta cyclotis ) and savanna ( L. africana ) elephants on the IUCN Red List both highlights the different threats of extinction faced by these two species and emphasizes the need for genetic data to classify taxonomically undefined populations across the continent. This includes western Uganda – a region that harbors the largest known modern hybrid zone between the two species. We combined a new high-throughput amplicon sequencing (HTAS) approach with fecal DNA-based Capture Mark Recapture (CMR) analysis to infer the population sizes and species compositions of elephants living in two forests. We demonstrate that Kibale National Park hosts a relatively large elephant population (573 individuals, 95% CI: 410 to 916; 0.72 elephants/km 2 ) composed primarily of hybrids (81.5%) and savanna elephants (17.7%), while Bwindi Impenetrable National Park hosts a smaller population (96 individuals, 95% CI: 64 to 145; 0.29 elephants/km 2 ) composed of forest elephants (86.8%) and hybrids (13.2%). We then sequenced maternally inherited (mtDNA) and paternally inherited (AMELY) genetic markers and found that the two parks’ populations exhibit different patterns of sex-linked genetic variation. The contrasting patterns of species identity and genetic variation between these parks demonstrate different histories of hybridization and highlight the importance of site-specific monitoring where elephants are taxonomically undefined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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