Transcriptome data from the interdigital webs of the Chinese Soft-shell Turtle (Pelodiscus sinensis)
Notice bibliographique
Résumé
The interdigital webs of aquatic tetrapods are a key structure evolved for adaptation, which are formed by inhibiting interdigital cell death (ICD). Diverse interdigital morphologies have independently evolved among species, and the regulatory mechanisms responsible for their development are still not fully understood. The Chinese soft-shell turtle (Pelodiscus sinensis) serves as a good research model that exhibits transitional traits from webless to fully webbed. In this study, we collected eight samples of interdigital webs from the fore- and hindlimbs of turtles at embryonic stage 19 (TK19) for RNA sequencing (RNA-seq) analysis. We identified 608 differentially expressed genes (DEGs). Whole-mount in situ hybridization (WISH) and real-time quantitative PCR (RT-qPCR) of representative genes confirmed the accuracy of the transcriptomic results. These findings not only provide new perspectives and data to support comparative studies of adaptive convergent evolution in aquatic animals but also enhance our understanding of the mechanisms underlying tetrapod limb morphogenesis. Furthermore, these results provide potential molecular targets for research on the plasticity of programmed cell death or senescence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».